RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574236.5

PHF23-208, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-208ENST00000574236 DEFB133Q30KQ1 61 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 BRAT1Q6PJG6 821 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 LZTR1Q8N653 840 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 LMX1AQ8TE12 382 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 PSKH2Q96QS6 385 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 LAMA5O15230 3695 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 AQP9O43315 295 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 MAFKO60675 156 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 CDK4P11802 303 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 CR2P20023 1033 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 PTMSP20962 102 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 SERPINA4P29622 427 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 THOP1P52888 689 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 KCTD16Q68DU8 428 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 PHACTR4Q8IZ21 702 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 RFFLQ8WZ73 363 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 DKK4Q9UBT3 224 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 SEPT3Q9UH03 358 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 H3BM21 787 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 MYO1FO00160 1098 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 CDH6P55285 790 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 TAS2R40P59535 323 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 YPEL5P62699 121 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 BCL2L1Q07817 233 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 LRRC14Q15048 493 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 CFAP58Q5T655 872 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 ERAP2Q6P179 960 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 MACC1Q6ZN28 852 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 FAM181AQ8N9Y4 354 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 PLA2G15Q8NCC3 412 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 FAM71BQ8TC56 605 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 ZNF599Q96NL3 588 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 LRRC61Q9BV99 259 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 CLPBQ9H078 707 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 FAM208BQ5VWN6 2430 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-208ENST00000574236 NEMP2A6NFY4 417 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 A8MX80 341 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ALPPL2P10696 532 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 HNF1BP35680 557 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 GJC1P36383 396 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 MAXP61244 160 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 KRT81Q14533 505 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 HS1BP3Q53T59 392 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 C19orf48Q6RUI8 117 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PELI3Q8N2H9 469 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 DNAJC7Q99615 494 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 GPSM3Q9Y4H4 160 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 OR1A2Q9Y585 309 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa23.39■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CASC3O15234 703 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 MFSD11O43934 449 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PCCBP05166 539 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 AP1S1P61966 158 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PTK2BQ14289 1009 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ZNF235Q14590 738 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 INPP5AQ14642 412 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 AGERQ15109 404 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PTPRRQ15256 657 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TCEA2Q15560 299 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PRRT3Q5FWE3 981 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 LIPIQ6XZB0 460 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 DPPA4Q7L190 304 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 APOOQ9BUR5 198 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 NOD2Q9HC29 1040 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.38■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PROSCO94903 275 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 MAP3K6O95382 1288 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 MT-CO3P00414 261 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 RENBPP51606 427 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 TRAF2Q12933 501 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 DPYSL3Q14195 570 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SLC18A3Q16572 532 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 CDKN3Q16667 212 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ALG11Q2TAA5 492 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 FAXCQ5TGI0 409 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 GUSBP11Q6P575 273 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 ATPAF2Q8N5M1 289 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 RNF214Q8ND24 703 aa23.37■■□□□ 1.33
PHF23-208ENST00000574236 PCDH19Q8TAB3 1148 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms