RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	MON1A	Q86VX9	555 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	HASPIN	Q8TF76	798 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	NDN	Q99608	321 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	ADA2	Q9NZK5	511 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		18.52	■□□□□ 0.56
RRN3-205	ENST00000563559	NEMP2	A6NFY4	417 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	GPC4	O75487	556 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PEX11B	O96011	259 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA24	Q86W54	205 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	RNF135	Q8IUD6	432 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	RIN3	Q8TB24	985 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NT5M	Q9NPB1	228 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SARDH	Q9UL12	918 aa		18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	BPTF	Q12830	3046 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PQH9	124 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	AURKA	O14965	403 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	IMPDH1	P20839	514 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CD52	P31358	61 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ITK	Q08881	620 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	LAMB3	Q13751	1172 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	RNF148	Q8N7C7	305 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	NMUR1	Q9HB89	426 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SPC25	Q9HBM1	224 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SCML2	Q9UQR0	700 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		18.51	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MROH6	A6NGR9	719 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PML	P29590	882 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CD86	P42081	329 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	DSC3	Q14574	896 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	GK5	Q6ZS86	529 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A13	Q96H72	371 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PLK2	Q9NYY3	685 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	MGEA5	O60502	916 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	KCNA5	P22460	613 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	YY1	P25490	414 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	THPO	P40225	353 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PGF	P49763	221 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PRAME	P78395	509 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TNK2	Q07912	1038 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SP110	Q9HB58	689 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		18.5	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559		H0YJX3	145 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TNFAIP8	O95379	198 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	CRTAM	O95727	393 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	ATP4B	P51164	291 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TBX4	P57082	545 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	C1QTNF8	P60827	252 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	LRP8	Q14114	963 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	AGK	Q53H12	422 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	LILRA2	Q8N149	483 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	AHI1	Q8N157	1196 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	TEX26	Q8N6G2	289 aa		18.49	■□□□□ 0.55
RRN3-205	ENST00000563559	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		18.49	■□□□□ 0.55

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