RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	GGT5	P36269	586 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	RAD23B	P54727	409 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CALCRL	Q16602	461 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	KIF19	Q2TAC6	998 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMED6	Q8WW62	240 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GGA3	Q9NZ52	723 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF580	Q9UK33	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	HSPB2	A8KAH6	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	BTBD18	B2RXH4	712 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMP2	P08253	660 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ETFA	P13804	333 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	TNFRSF8	P28908	595 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ABCD1	P33897	745 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	GNAQ	P50148	359 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	TUBA1B	P68363	451 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	HSPB2	Q16082	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAF1	Q8N7H5	531 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLD5	Q8N7P1	536 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	BEST2	Q8NFU1	509 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	WASF1	Q92558	559 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNAPC3	Q92966	411 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	KLHL15	Q96M94	604 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	FIZ1	Q96SL8	496 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	KXD1	Q9BQD3	176 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787		A0A0U1RQF3	1178 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	C4orf47	A7E2U8	309 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP17L23	D6RBM5	183 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	WNT9B	O14905	357 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	TF	P02787	698 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	HOXB5	P09067	269 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT9	P35527	623 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CLDN2	P57739	230 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	XKR9	Q5GH70	373 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	NAXE	Q8NCW5	288 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	PREB	Q9HCU5	417 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PAPOLA-222	ENST00000556787	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	hDV102S1	A0JD36	115 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787		A6NLC8	198 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEC14L5	O43304	696 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CPOX	P36551	454 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	LINGO2	Q7L985	606 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SMARCE1	Q969G3	411 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HARBI1	Q96MB7	349 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SARDH	Q9UL12	918 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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