RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553686.5

ATXN3-223, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 869 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-223	ENST00000553686	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	HES3	Q5TGS1	186 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	C4orf19	Q8IY42	314 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	RAB24	Q969Q5	203 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	HIC2	Q96JB3	615 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	TEKT5	Q96M29	485 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	NID2	Q14112	1375 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	COL4A2	P08572	1712 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	E2F8	A0AVK6	867 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CCDC154	A6NI56	674 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ELANE	P08246	267 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CYP21A2	P08686	494 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CD6	P30203	668 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ARL2	P36404	184 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CTXN1	P60606	82 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	KRT85	P78386	507 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	SMARCB1	Q12824	385 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ILK	Q13418	452 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	IL10RA	Q13651	578 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ODF1	Q14990	250 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686		Q4G0T1	1027 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	EMC10	Q5UCC4	262 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	TXNDC8	Q6A555	127 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	EXD3	Q8N9H8	876 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	IGSF8	Q969P0	613 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	TMX3	Q96JJ7	454 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	SEMA3C	Q99985	751 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	FZD8	Q9H461	694 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	TMEM206	Q9H813	350 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	NOTCH4	Q99466	2003 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ATM	Q13315	3056 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	FLNC	Q14315	2725 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686		A0A1B0GVT2	93 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	MTMR11	A4FU01	709 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	LAD1	O00515	517 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ACKR2	O00590	384 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	PRC1	O43663	620 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	VNN2	O95498	520 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	OR4Q2	P0C623	313 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	HOXB2	P14652	356 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	GLRA2	P23416	452 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	GCSH	P23434	173 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	NTSR1	P30989	418 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	MCM5	P33992	734 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	TP53BP2	Q13625	1128 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	ZNF77	Q15935	545 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	FITM2	Q8N6M3	262 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	GJA10	Q969M2	543 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	MMS19	Q96T76	1030 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	AGAP2	Q99490	1192 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	THSD1	Q9NS62	852 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ATXN3-223	ENST00000553686	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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