RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536159.2

CITED2-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CITED2, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-202ENST00000536159 RUNX3Q13761 415 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 LGSNQ5TDP6 509 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 ARMC3Q5W041 872 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 CAMK1DQ8IU85 385 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 CPA6Q8N4T0 437 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 CEP44Q9C0F1 390 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 DEC1Q9P2X7 70 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 A0A1W2PPM1 405 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 GOLGA8TH3BQL2 631 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 EBAG9O00559 213 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 VAPBO95292 243 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 DRD4P21917 467 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 NNMTP40261 264 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 NAB1Q13506 487 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 TSTD2Q5T7W7 516 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 PAF1Q8N7H5 531 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 ANKRD42Q8N9B4 389 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 BRSK1Q8TDC3 778 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 DYDC1Q8WWB3 177 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 TREX1Q9NSU2 369 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.048e-8■■■□□ 18
CITED2-202ENST00000536159 MYOFQ9NZM1 2061 aa21.53■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 ANKRD66B4E2M5 251 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 PIGNO95427 931 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 GDI1P31150 447 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 SLC8A1P32418 973 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 LAMB3Q13751 1172 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 COL19A1Q14993 1142 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 GAB4Q2WGN9 574 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 MYLK3Q32MK0 819 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 CARD16Q5EG05 197 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 ARMC12Q5T9G4 340 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 GRAMD4Q6IC98 578 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 CNPY4Q8N129 248 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 SMRP1Q8NCR6 262 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 AGAP2Q99490 1192 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 TXNDC16Q9P2K2 825 aa21.52■■□□□ 1.04
CITED2-202ENST00000536159 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 MROH6A6NGR9 719 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 KRT37O76014 449 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 GSRP00390 522 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 KRT4P19013 534 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 EPHB1P54762 984 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 LRRC14Q15048 493 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 C4orf33Q8N1A6 199 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 MGARPQ8TDB4 240 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 CD207Q9UJ71 328 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 KCTD3Q9Y597 815 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 ARL5AQ9Y689 179 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 MYLKQ15746 1914 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 REV3LO60673 3130 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 LDB2O43679 373 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 FZD6O60353 706 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 ECI2O75521 394 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 KRT38O76015 456 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 ASMTLO95671 621 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 MT-ND3P03897 115 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 QPCTQ16769 361 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 PACS1Q6VY07 963 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 CPLX4Q7Z7G2 160 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 MRGPRX3Q96LB0 322 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 SMIM14Q96QK8 99 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 ELOVL2Q9NXB9 296 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 SPO11Q9Y5K1 396 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 PSAT1Q9Y617 370 aa21.51■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 H3BQ06 376 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 SPAG7O75391 227 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 PGLSO95336 258 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 CRTAMO95727 393 aa21.5■■□□□ 1.03
CITED2-202ENST00000536159 ASLP04424 464 aa21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms