RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 FNIP2Q9P278 1114 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDRG3Q9UGV2 375 aa2.79□□□□□ -1.96
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RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFS7O75251 213 aa2.78□□□□□ -1.96
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RNU6-277P-201ENST00000516272 UBXN6Q9BZV1 441 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLHL1Q9NR64 748 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1RLQ9NZP8 487 aa2.76□□□□□ -1.97
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RNU6-277P-201ENST00000516272 EBAG9O00559 213 aa2.75□□□□□ -1.97
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RNU6-277P-201ENST00000516272 CD53P19397 219 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPTP24298 496 aa2.75□□□□□ -1.97
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