RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516206.1

RNU6-904P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 904, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-904P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-904P-201ENST00000516206 H3BML4 177 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 WDR1O75083 606 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 OFD1O75665 1012 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 TNFRSF6BO95407 300 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MT-ND5P03915 603 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MELTFP08582 738 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ITGA5P08648 1049 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 NFKBIAP25963 317 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 GPR12P47775 334 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MMP14P50281 582 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 GAGE5Q13069 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 GAGE6Q13070 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ATP1A4Q13733 1029 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 KRTCAP3Q53RY4 240 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM268Q5VZI3 342 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 WSCD1Q658N2 575 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MRNIPQ6NTE8 343 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 RNF44Q7L0R7 432 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 WDR63Q8IWG1 891 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZBED8Q8IZ13 594 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 C22orf23Q9BZE7 217 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 LAT2Q9GZY6 243 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLITRK2Q9H156 845 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 RAD21L1Q9H4I0 556 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 CERS4Q9HA82 394 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ADPRHL2Q9NX46 363 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC25A13Q9UJS0 675 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 OSGIN2Q9Y236 505 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 A0A1W2PPR1 153 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM247A6NEH6 219 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 DUXAA6NLW8 204 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 KATNA1O75449 491 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 VIPP01282 170 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 HMBSP08397 361 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 CYP3A4P08684 503 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 GP9P14770 177 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MYOD1P15172 320 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF19P17023 458 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 CHATP28329 748 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 STX2P32856 288 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 HNF4AP41235 474 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MTHFRP42898 656 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 OAZ1P54368 228 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 EPHB1P54762 984 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ISL1P61371 349 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 CCDC96Q2M329 555 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 KIAA1644Q3SXP7 199 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZACNQ401N2 412 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 TBC1D9BQ66K14 1250 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 TRNP1Q6NT89 227 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ASB18Q6ZVZ8 466 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MAEAQ7L5Y9 396 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 SESTD1Q86VW0 696 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 CCDC28AQ8IWP9 274 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 C1orf87Q8N0U7 546 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 GPD1LQ8N335 351 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 CEP70Q8NHQ1 597 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARHGEF26Q96DR7 871 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 SNX22Q96L94 193 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MGME1Q9BQP7 344 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 PAAF1Q9BRP4 392 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 SYT17Q9BSW7 474 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 SCRT1Q9BWW7 348 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 HDHD5Q9BXW7 423 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MYOZ2Q9NPC6 264 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 FSCN3Q9NQT6 498 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 CHPF2Q9P2E5 772 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 LRWD1Q9UFC0 647 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 TUBE1Q9UJT0 475 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 IKZF3Q9UKT9 509 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 OGDHLQ9ULD0 1010 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 KCNJ14Q9UNX9 436 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 AMDHD2Q9Y303 409 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 OR2W1Q9Y3N9 320 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 RSPH10B2B2RC85 870 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 VIL1P09327 827 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 RSPH10BP0C881 870 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-904P-201ENST00000516206 SRGAP2BP0DMP2 458 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms