RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 TAF10Q12962 218 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC5A9Q2M3M2 681 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 PAOXQ6QHF9 649 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 DEFB128Q7Z7B8 93 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 PIM3Q86V86 326 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 HMCESQ96FZ2 354 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ZYG11BQ9C0D3 744 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 MIOSQ9NXC5 875 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 MYO1GB0I1T2 1018 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FFAR3O14843 346 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR42O15529 346 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB14O43829 449 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 IPO13O94829 963 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ALDH2P05091 517 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 DHRS4L1P0CG22 281 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 WARSP23381 471 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 DUSP4Q13115 394 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 NEDD8Q15843 81 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 AAGABQ6PD74 315 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ZYG11AQ6WRX3 759 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 HS6ST3Q8IZP7 471 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 BEGAINQ9BUH8 593 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM8Q9BZR9 551 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 SYCE1LA8MT33 242 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.351e-6■■□□□ 14.5
RABGEF1-211ENST00000503687 GNAZP19086 355 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP6V1B2P21281 511 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CES1P23141 567 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR15P49685 360 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 HGH1Q9BTY7 390 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC106Q9BWC9 280 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO44Q9H4M3 255 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CASS4Q9NQ75 786 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TLL2Q9Y6L7 1015 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 LINGO3P0C6S8 592 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CKMT2P17540 419 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 AKT1P31749 480 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CDH18Q13634 790 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 C16orf87Q6PH81 154 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 DENND1CQ8IV53 801 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 DHRS4Q9BTZ2 278 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 OXSMQ9NWU1 459 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CRLS1Q9UJA2 301 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TCAF1Q9Y4C2 921 aa12.86□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TNFAIP8O95379 198 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TUSC3Q13454 348 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 GTF2H3Q13889 308 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 LIN52Q52LA3 116 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 LINGO4Q6UY18 593 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 OR7D4Q8NG98 312 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FAXDC2Q96IV6 333 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CATSPERZQ9NTU4 200 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 WWOXQ9NZC7 414 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 PKD2L2Q9NZM6 624 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A088AWK7 358 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CRTAMO95727 393 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC2A4P14672 509 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 AOC1P19801 751 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGEF7Q14155 803 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 LPCAT2Q7L5N7 544 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 SPPL2CQ8IUH8 684 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 SHKBP1Q8TBC3 707 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ARNTL2Q8WYA1 636 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 LRTOMTQ8WZ04 291 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 FIG4Q92562 907 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ERLEC1Q96DZ1 483 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAMTS10Q9H324 1103 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 SYTL2Q9HCH5 934 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 PLK2Q9NYY3 685 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 NUMBLQ9Y6R0 609 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A087X1B8 175 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 UBXN8O00124 270 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 AURKAO14965 403 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 NRP2O60462 931 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 TLR5O60602 858 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 ALBP02768 609 aa12.85□□□□□ -0.35
RABGEF1-211ENST00000503687 CTPS1P17812 591 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms