RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	MCM3	P25205	808 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	CCDC6	Q16204	474 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	SYT16	Q17RD7	645 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TIGD6	Q17RP2	521 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ACCSL	Q4AC99	568 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ESCO2	Q56NI9	601 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	WDR73	Q6P4I2	378 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ALG14	Q96F25	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	C1RL	Q9NZP8	487 aa		3.57	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	KLRF2	D3W0D1	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	STX16	O14662	325 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	EDIL3	O43854	480 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	SETSIP	P0DME0	302 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	SRC	P12931	536 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	HDAC4	P56524	1084 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	MOB3C	Q70IA8	216 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TCF19	Q9Y242	345 aa		3.56	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	CBY3	A6NI87	242 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	HSPB2	A8KAH6	182 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	EBAG9	O00559	213 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	CDH1	P12830	882 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ECT2L	Q008S8	904 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ICA1	Q05084	483 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ARHGEF6	Q15052	776 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	HSPB2	Q16082	182 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	MAP9	Q49MG5	647 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	BBS10	Q8TAM1	723 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	SNAPC3	Q92966	411 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	SLC32A1	Q9H598	525 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	KLHL1	Q9NR64	748 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		3.55	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268		A0A0U1RQF3	1178 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268		A0A1W2PS18	150 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ASPDH	A6ND91	283 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	FAM155B	O75949	473 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	STX2	P32856	288 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	FOXO1	Q12778	655 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TMEM219	Q86XT9	240 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	GJC3	Q8NFK1	279 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	RILPL2	Q969X0	211 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TWNK	Q96RR1	684 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	LITAF	Q99732	161 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TINAG	Q9UJW2	476 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		3.54	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	FAM72C	H0Y354	149 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	PRC1	O43663	620 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	KLK8	O60259	260 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TIPRL	O75663	272 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	RFPL2	O75678	378 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	EDN2	P20800	178 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	CLDN2	P57739	230 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	NOXA1	Q86UR1	476 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	FAM72B	Q86X60	149 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	3.53	□□□□□ -1.84
USP34-222	ENST00000498268	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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