RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH19Q9H159 772 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EBF3Q9H4W6 596 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCML2Q9UQR0 700 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MYOFQ9NZM1 2061 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF195O14628 629 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FKTNO75072 461 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEC24AO95486 1093 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACRP10323 421 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COX4I1P13073 169 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR1E1P30953 314 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HCAR3P49019 387 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDC16Q13042 620 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIP10Q15642 601 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRAMD1BQ3KR37 738 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MANEALQ5VSG8 457 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM91A1Q658Y4 838 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM135Q86UB9 458 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DENND1CQ8IV53 801 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LGI2Q8N0V4 545 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRGPRX2Q96LB1 330 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SP110Q9HB58 689 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP4F12Q9HCS2 524 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15.63■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MT-CO1P00395 513 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AHSGP02765 367 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX2P28328 305 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC6A4P31645 630 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WNT3AP56704 352 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH17Q12864 832 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX32Q86XE0 403 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGBD5Q8N414 524 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ECSITQ9BQ95 431 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA16Q9BXB7 569 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C2orf78A6NCI8 922 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NEMP2A6NFY4 417 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RAG1P15918 1043 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD151P48509 253 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLK1P53350 603 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLF10Q13118 480 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNIQ14094 377 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC153Q494R4 210 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYS1Q717R9 158 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT8Q92599 483 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HAPLN3Q96S86 360 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TTPALQ9BTX7 342 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 S100A14Q9HCY8 104 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RRN3Q9NYV6 651 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMCO1Q9UM00 188 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa15.62■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F8W8V4 182 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MATN3O15232 486 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARNTP27540 789 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PLD1Q13393 1074 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PRPSAP1Q14558 356 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TBCCQ15814 346 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF470Q6ECI4 717 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LINGO4Q6UY18 593 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP97Q8IW35 865 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC43A3Q8NBI5 491 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POMPQ9Y244 141 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AK5Q9Y6K8 562 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NCAM2O15394 837 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMCC1O94876 653 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AIF1P55008 147 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XPR1Q9UBH6 696 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.61■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK7P50613 346 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DEFB103AP81534 67 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFT2D3Q587I9 215 aa15.6■□□□□ 0.09
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM156AQ8NDB6 213 aa15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms