RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481037.5

RBM39-232, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 687 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-232ENST00000481037 ITPR2Q14571 2701 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 LRBAP50851 2863 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 NOTCH4Q99466 2003 aa6.21□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 PSMD9O00233 223 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 EXTL3O43909 919 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 RNF8O76064 485 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 MT-CO3P00414 261 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 PRKAG1P54619 331 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 SEMA3BQ13214 749 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 CERCAMQ5T4B2 595 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 SLC15A4Q8N697 577 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ITFG1Q8TB96 612 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ING5Q8WYH8 240 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 PIGKQ92643 395 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 DNASE1L2Q92874 299 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 FAM149AA5PLN7 773 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 CES2O00748 559 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TEX28O15482 410 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 PMPCBO75439 489 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ABLIM3O94929 683 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 RAB1AP62820 205 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 LMAN2Q12907 356 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 FGL2Q14314 439 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 MLC1Q15049 377 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 DEF8Q6ZN54 512 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 PXMP2Q9NR77 195 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 PTPRCP08575 1304 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 COL4A2P08572 1712 aa6.19□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 GON4LQ3T8J9 2241 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 A0A088AWK7 358 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 M0R3H8 397 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ECI2O75521 394 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 AKAP3O75969 853 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 URODP06132 367 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 GDI1P31150 447 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 HOXA6P31267 233 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TFAP4Q01664 338 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 PLA1AQ53H76 456 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 MEIS3Q99687 375 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 WWOXQ9NZC7 414 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 VWA8A3KMH1 1905 aa6.18□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 CD8B2A6NJW9 211 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 GOLIM4O00461 696 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 CCL16O15467 120 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 SH3BP5O60239 455 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 GALTP07902 379 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 TGFB3P10600 412 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 THBS4P35443 961 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 THBS3P49746 956 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ARFIP2P53365 341 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 SEMG2Q02383 582 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 ZNF91Q05481 1191 aa6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RBM39-232ENST00000481037 MAPK6Q16659 721 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms