RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 DSC2Q02487 901 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 CCDC173Q0VFZ6 552 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 OVGP1Q12889 678 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 XRCC4Q13426 336 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PCSK7Q16549 785 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ZNF284Q2VY69 593 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 INAVAQ3KP66 663 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 MAML1Q92585 1016 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 VAT1Q99536 393 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 CEP41Q9BYV8 373 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 GAREM1Q9H706 876 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 TRHDEQ9UKU6 1024 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.64□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 TRPM6Q9BX84 2022 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 A0A0U1RQJ8 604 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 A6NNZ2 444 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 RNF103O00237 685 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 MUSKO15146 869 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 KCNN4O15554 427 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 LATO43561 262 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 GDF9O60383 454 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 HLA-DQB2P05538 268 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 RBP3P10745 1247 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 CTPS1P17812 591 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 HTR1BP28222 390 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PTPN7P35236 360 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ABL2P42684 1182 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 LMAN1P49257 510 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 LIG3P49916 1009 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PEX5P50542 639 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 TAS2R38P59533 333 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 GRIK2Q13002 908 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PTK2BQ14289 1009 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 LRRC14Q15048 493 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 TAZQ16635 292 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 HLA-BQ31612 363 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 TEX44Q53QW1 395 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ZNF569Q5MCW4 686 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 IQCHQ86VS3 1027 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PGBD5Q8N414 524 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 OXR1Q8N573 874 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ATL2Q8NHH9 583 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ACTL9Q8TC94 416 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 HES6Q96HZ4 224 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 RTKNQ9BST9 563 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 GLOD4Q9HC38 313 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 FZD3Q9NPG1 666 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 CHKBQ9Y259 395 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ITM2BQ9Y287 266 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.63□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PIEZO1Q92508 2521 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 VPS13AQ96RL7 3174 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 YKT6O15498 198 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 CEP104O60308 925 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PMPCBO75439 489 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ANXA9O76027 345 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PGLSO95336 258 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PEX11BO96011 259 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 PRKCGP05129 697 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ITGAVP06756 1048 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 THEGLP0DJG4 465 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 ITIH2P19823 946 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 VIPR1P32241 457 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 RABIFP47224 123 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 LIMK1P53667 647 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 CLDN2P57739 230 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 SEMG2Q02383 582 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 KIF19Q2TAC6 998 aa9.62□□□□□ -0.87
PKP4-208ENST00000462335 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms