RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 A0A0D9SEW6 157 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CDRT15L2A8MXV6 281 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 PRPSAP2O60256 369 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 LEFTY1O75610 366 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 NEBLO76041 1014 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 MYF5P13349 255 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 KRT10P13645 584 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ADRB3P13945 408 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 TGM2P21980 687 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 EPHB2P29323 1055 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 L1CAMP32004 1257 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ETFBP38117 255 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CSRP3P50461 194 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 BLKP51451 505 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FZD2Q14332 565 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SEL1L3Q68CR1 1132 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FOXR1Q6PIV2 292 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 LMX1AQ8TE12 382 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ARRDC3Q96B67 414 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 EPAS1Q99814 870 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 HEPHQ9BQS7 1158 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DESI2Q9BSY9 194 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ISCUQ9H1K1 167 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FZD10Q9ULW2 581 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 AP4E1Q9UPM8 1137 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 U3KQA8 63 aa11.82□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ILVBLA1L0T0 632 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 TNFSF15O95150 251 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 NDUFA10O95299 355 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 MT-CO1P00395 513 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ITGB2P05107 769 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ANXA6P08133 673 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 RHOQP17081 205 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 TPI1P60174 286 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 YPEL5P62699 121 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 GNA12Q03113 381 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ZNF542PQ5EBM4 170 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 GUSBP11Q6P575 273 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ACRBPQ8NEB7 543 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 OR6C4Q8NGE1 309 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 BTBD6Q96KE9 485 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 BMFQ96LC9 184 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 PSMB7Q99436 277 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 NUP85Q9BW27 656 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 BOCQ9BWV1 1114 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ZWILCHQ9H900 591 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SEPT10Q9P0V9 454 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ANAPC7Q9UJX3 599 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 POM121BA6NF01 834 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 LMO7DNF2Z398 122 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 K7ERQ8 282 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 MUSKO15146 869 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DAPK3O43293 454 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 RAMP2O60895 175 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ALPIP09923 528 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 MIPP30301 263 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 GJC1P36383 396 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ACVRL1P37023 503 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 MAPKAPK2P49137 400 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DNA2P51530 1060 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 AIF1P55008 147 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SPA17Q15506 151 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SMTNL2Q2TAL5 461 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.8□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CARD16Q5EG05 197 aa11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms