RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434982.2

ANKRD55-202, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD55, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-202ENST00000434982 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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ANKRD55-202ENST00000434982 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.48□□□□□ -1.05
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ANKRD55-202ENST00000434982 ITGB7P26010 798 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NUDT1P36639 197 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 ETFBP38117 255 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 NEK3P51956 506 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CLDN6P56747 220 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD55-202ENST00000434982 SCAPQ12770 1279 aa8.45□□□□□ -1.06
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