RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 RABGGTBP53611 331 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 OTOP3Q7RTS5 596 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PGBD5Q8N414 524 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HM13Q8TCT9 377 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LPGAT1Q92604 370 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 IL37Q9NZH6 218 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DMTF1Q9Y222 760 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR45Q9Y5Y3 372 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 WASH4PA8MWX3 477 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BRB1 525 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TIMM44O43615 452 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 CD160O95971 181 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 C7P10643 843 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM160B1Q5W0V3 765 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PKN3Q6P5Z2 889 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM171BQ6P995 826 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DLEU7Q6UYE1 221 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DPH6Q7L8W6 267 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TAC4Q86UU9 113 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX31Q8N9S9 440 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIB3Q96RU7 358 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 BRINP2Q9C0B6 783 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SCUBE2Q9NQ36 999 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SQORQ9Y6N5 450 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BMQ9 156 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 H3BNC9 293 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM38O00635 465 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MUSKO15146 869 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEB3O15480 346 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SCN2BO60939 215 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFAIP8O95379 198 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 NPR3P17342 541 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FDXRP22570 491 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF6Q58WW2 860 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM45BPQ6NSW5 357 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 BTLAQ7Z6A9 289 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DPP10Q8N608 796 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TOP6BLQ8N6T0 577 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM45AQ8TCE6 357 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM125Q96AQ2 219 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP42Q96MM3 310 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 COG8Q96MW5 612 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 APOL2Q9BQE5 337 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 BRD8Q9H0E9 1235 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 IKZF5Q9H5V7 419 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 EBF1Q9UH73 591 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 APPL1Q9UKG1 709 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 VANGL2Q9ULK5 521 aa3.65□□□□□ -1.82
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PPW3 197 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP12BA6NM10 295 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DDHD2O94830 711 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VTNP04004 478 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINB5P36952 375 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CD97P48960 835 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ADIGQ0VDE8 80 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LGSNQ5TDP6 509 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT3A1Q6NUS8 523 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GK5Q6ZS86 529 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MOB2Q70IA6 237 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 C14orf80Q86SX3 495 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNMB4Q86W47 210 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP12AQ8IXF9 295 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP70Q8NHQ1 597 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LRTOMTQ8WZ04 291 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 STMN2Q93045 179 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MYEOVQ96EZ4 313 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NPAS2Q99743 824 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 USP22Q9UPT9 525 aa3.65□□□□□ -1.83
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