RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TMEM131Q92545 1883 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC66A2RUB6 948 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNK1O00180 336 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TGM2P21980 687 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 NR2C2P49116 596 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEMG2Q02383 582 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 DSC2Q02487 901 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 RALGDSQ12967 914 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZBTB17Q13105 803 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SGCGQ13326 291 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPM1JQ5JR12 505 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CNTD1Q8N815 330 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALG3Q92685 438 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 KLHDC7BQ96G42 594 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 GDF3Q9NR23 364 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A1B0GTQ1 180 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 POM121BA6NF01 834 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCNX2A6NKB5 2137 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 GIPC1O14908 333 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TM7SF2O76062 418 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNK5O95279 499 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 JCHAINP01591 159 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SHBQ15464 509 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERAP2Q6P179 960 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 DEFB124Q8NES8 71 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 OR13H1Q8NG92 308 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CENPTQ96BT3 561 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 HERPUD2Q9BSE4 406 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPR27Q9NS67 375 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CACNA1AO00555 2505 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SPTBN2O15020 2390 aa22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A1W2PQ67 120 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 DFNA5O60443 496 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 MAGEC1O60732 1142 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PGLSO95336 258 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 THEGLP0DJG4 465 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCT8P50990 548 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 COPS2P61201 443 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM193AP78312 1265 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCZ1BP86790 482 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ITKQ08881 620 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 AP1B1Q10567 949 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 BBS12Q6ZW61 710 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 DPPA4Q7L190 304 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 AMFRQ9UKV5 643 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 A6NNZ2 444 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SH3BP5O60239 455 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHGA12O60330 932 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 FZD6O60353 706 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CPP00450 1065 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 C6P13671 934 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CES1P23141 567 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 RXRGP48443 463 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 LIG3P49916 1009 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 RWDD2BP57060 319 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PEX26Q7Z412 305 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM174AQ8TBP5 190 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 COQ6Q9Y2Z9 468 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-20-201ENST00000390606 CFAP69A5D8W1 941 aa22.14■■□□□ 1.13
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