RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355396.7

SUSD1-201, Transcript of sushi domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SUSD1, Length 2,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1-201ENST00000355396 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 MID1O15344 667 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 TP73O15350 636 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 LAMTOR5O43504 91 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 ZNF217O75362 1048 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 AP2A1O95782 977 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 IFNB1P01574 187 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 IL1BP01584 269 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 DNTTP04053 509 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 UGT2B4P06133 528 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 ZSWIM9Q86XI8 627 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 LYSMD1Q96S90 227 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 EML5Q05BV3 1969 aa11.66□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 GOLGA6CA6NDK9 693 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 GOLGA6BA6NDN3 693 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 AREL1O15033 823 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 GOLGA6DP0CG33 693 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 TIMP2P16035 220 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 TPSB2P20231 275 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 PSMD8P48556 350 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 METAP1P53582 386 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 WNT3AP56704 352 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 CDK16Q00536 496 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 CDK18Q07002 472 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 TPSAB1Q15661 275 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 FAM182AQ5T1J6 154 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 AGBL4Q5VU57 503 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 SLC6A17Q9H1V8 727 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 MUC3AQ02505 3323 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 FAM86C2PA6NEL3 165 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 SPINT1O43278 529 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 BNIP3LO60238 219 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 OXTRP30559 389 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 P2RY2P41231 377 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 TPMTP51580 245 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 NEK3P51956 506 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 KCNJ11Q14654 390 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 MAP7D1Q3KQU3 841 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 IQCKQ8N0W5 287 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 HMGB4Q8WW32 186 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.65□□□□□ -0.54
SUSD1-201ENST00000355396 DLL1O00548 723 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 NDST3O95803 873 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 PDHA1P08559 390 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 HLA-DPA1P20036 260 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 GRIA4P48058 902 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 CNTN1Q12860 1018 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 UGP2Q16851 508 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 SGK2Q9HBY8 427 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 SERGEFQ9UGK8 458 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 SNX24Q9Y343 169 aa11.65□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 UPK3BL1B0FP48 263 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 UPK3BL2E5RIL1 263 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 CPP00450 1065 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 ADRB3P13945 408 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 TAS2R38P59533 333 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 TMEM52BQ4KMG9 183 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 ARMC3Q5W041 872 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 ANO7Q6IWH7 933 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 LONP2Q86WA8 852 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 MCUQ8NE86 351 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 SCRN2Q96FV2 425 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 SH3GL2Q99962 352 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 ADGRE3Q9BY15 652 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.64□□□□□ -0.55
SUSD1-201ENST00000355396 RAB6BQ9NRW1 208 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms