RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 LPOP22079 712 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SRP54P61011 504 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PAGE2Q7Z2X7 111 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SMYD1Q8NB12 490 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 DUSP16Q9BY84 665 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TP73O15350 636 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ITGAVP06756 1048 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 FAM171BQ6P995 826 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PGM2Q96G03 612 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PSMD11O00231 422 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ALG11Q2TAA5 492 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA0408Q6ZU52 694 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ASNA1O43681 348 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PAGE1O75459 146 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ITGA1P56199 1179 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SPIBQ01892 262 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ECM1Q16610 540 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFAF6Q330K2 333 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC19Q96DA6 116 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GINS4Q9BRT9 223 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF670Q9BS34 389 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 C2CD2Q9Y426 696 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 DNTTP04053 509 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SEMA5AQ13591 1074 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 DEF8Q6ZN54 512 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PPP3R2Q96LZ3 170 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SAR1AQ9NR31 198 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 NCANO14594 1321 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CCNYL3P0C7X3 344 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 NOMO3P69849 1222 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PROSER1Q86XN7 944 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 BAP1Q92560 729 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL31Q9H511 634 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MST1RQ04912 1400 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MDM4O15151 490 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SASH3O75995 380 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GRM5P41594 1212 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 WASP42768 502 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MAPKAPK2P49137 400 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GPR158Q5T848 1215 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CEP68Q76N32 757 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PARP8Q8N3A8 854 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 IKZF3Q9UKT9 509 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GLUD1P00367 558 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ITGA2BP08514 1039 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MATKP42679 507 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SPANXN2Q5MJ10 180 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PACS1Q6VY07 963 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 EHD3Q9NZN3 535 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 RPS6KA6Q9UK32 745 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 URADA6NGE7 173 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6AP2O75787 350 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 RAPSNQ13702 412 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 CLN6Q9NWW5 311 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 RAB21Q9UL25 225 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM51Q9NW97 253 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 PRKCIP41743 596 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MYBPC1Q00872 1141 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MYO19Q96H55 970 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 GMPPBQ9Y5P6 360 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ADH1CP00326 375 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 MECRQ9BV79 373 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 HIPK3Q9H422 1215 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRM-201ENST00000332175 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms