RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNMB4Q86W47 210 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RASSF3Q86WH2 238 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD42Q8N9B4 389 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CALML6Q8TD86 181 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP2A3Q93084 1043 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 BHMTQ93088 406 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NUDCD1Q96RS6 583 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRE3Q9BY15 652 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SFXN1Q9H9B4 322 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NOD2Q9HC29 1040 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SPHK2Q9NRA0 654 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SMYD2Q9NRG4 433 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PLK2Q9NYY3 685 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL26Q9Y258 94 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 OR51B4Q9Y5P0 310 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GREB1Q4ZG55 1949 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO16Q9Y6X6 1858 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXO6A8MYZ6 492 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 COPEO14579 308 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MUSKO15146 869 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TM9SF1O15321 606 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SNAP91O60641 907 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SPAG7O75391 227 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TMCC1O94876 653 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GLDCP23378 1020 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NMBRP28336 390 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRNA4P43681 627 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SEPT6Q14141 434 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 DMC1Q14565 340 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHG6Q3KR16 790 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SIRPB2Q5JXA9 342 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MROH9Q5TGP6 573 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF43Q68DV7 783 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TMC5Q6UXY8 1006 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LINGO4Q6UY18 593 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PACS1Q6VY07 963 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM25Q86YD3 366 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC5BQ8IZJ1 945 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 BANPQ8N9N5 519 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 BRSK1Q8TDC3 778 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ACMSDQ8TDX5 336 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX13Q92968 403 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RMDN1Q96DB5 314 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ALG14Q96F25 216 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSWIM3Q96MP5 696 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GDF15Q99988 308 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 BBS2Q9BXC9 721 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A11Q9BYW1 496 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00597Q9H2U6 94 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCB8Q9NUT2 735 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKAG3Q9UGI9 489 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS51Q9UID3 782 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMM44O43615 452 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TYROBPO43914 113 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 VAPBO95292 243 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PAPLNO95428 1278 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CRTAMO95727 393 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PENKP01210 267 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CR2P20023 1033 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CSNK1DP48730 415 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 POLD2P49005 469 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NUMBP49757 651 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 AP1S1P61966 158 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ARF5P84085 180 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PPARDQ03181 441 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC18A2Q05940 514 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LMAN2Q12907 356 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MPP2Q14168 576 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF77Q15935 545 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CNGA3Q16281 694 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TSTD2Q5T7W7 516 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 STRA8Q7Z7C7 330 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CPLX4Q7Z7G2 160 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SRLQ86TD4 932 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LMNTD2Q8IXW0 634 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 APCDD1Q8J025 514 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MGARPQ8TDB4 240 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 BCAS4Q8TDM0 211 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 DENND1AQ8TEH3 1009 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MZB1Q8WU39 189 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRN2Q92932 1015 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CHMP6Q96FZ7 201 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM167BQ9BTA0 163 aa10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms