RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000310252.11

TTLL3-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 1,561 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-201ENST00000310252 SEMA5AQ13591 1074 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 GAS6Q14393 721 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SYT13Q7L8C5 426 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 TMIEQ8NEW7 156 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 GANCQ8TET4 914 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 PBXIP1Q96AQ6 731 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 CLDN23Q96B33 292 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 CENPTQ96BT3 561 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 RMDN1Q96DB5 314 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SNF8Q96H20 258 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 APOL2Q9BQE5 337 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 GORASP1Q9BQQ3 440 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 FICDQ9BVA6 458 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SARDHQ9UL12 918 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 PPM1HQ9ULR3 514 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 GOLGA8MH3BSY2 632 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 EBAG9O00559 213 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 RIPK2O43353 540 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 USP12O75317 370 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 AP2A1O95782 977 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 DNTTP04053 509 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ACADMP11310 421 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 XPAP23025 273 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SLC8A1P32418 973 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 DGKEP52429 567 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 COPAP53621 1224 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SATB1Q01826 763 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 GUCY1A3Q02108 690 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 TRAF2Q12933 501 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 OLIG2Q13516 323 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 IHHQ14623 411 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ARMC12Q5T9G4 340 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 KDELC1Q6UW63 502 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 RELL1Q8IUW5 271 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 PPIL6Q8IXY8 311 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 DNAAF3Q8N9W5 541 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 BBOF1Q8ND07 529 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 HMGB4Q8WW32 186 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 CPT1BQ92523 772 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SIPA1Q96FS4 1042 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 PPP1R16AQ96I34 528 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 TBL1YQ9BQ87 522 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ADGRE3Q9BY15 652 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SLC6A17Q9H1V8 727 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 CHRDQ9H2X0 955 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 FBRSQ9HAH7 460 aa11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 MYO1CO00159 1063 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 TNFRSF10AO00220 468 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SOCS5O75159 536 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ALDH1A2O94788 518 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 PGLSO95336 258 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 FAM107AO95990 144 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 SHBGP04278 402 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 PDHA1P08559 390 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 AOC1P19801 751 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 CCT5P48643 541 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ITGA8P53708 1063 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 CORO7P57737 925 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 RPS14P62263 151 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 GALNT3Q14435 633 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 CST6Q15828 149 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ZNF805Q5CZA5 627 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 FBXL19Q6PCT2 694 aa11.61□□□□□ -0.55
TTLL3-201ENST00000310252 LINC00523Q86TU6 105 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms