RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PAFAH1B1P43034 410 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SUOXP51687 545 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PPP2CBP62714 309 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PPP2CAP67775 309 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 FAM193AP78312 1265 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SEMG2Q02383 582 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ELP6Q0PNE2 266 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 IFT43Q96FT9 208 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PCED1AQ9H1Q7 454 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 METTL12A8MUP2 240 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SPINT1O43278 529 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN6O43657 245 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ANXA9O76027 345 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ETS1P14921 441 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PRPSAP1Q14558 356 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 P3H1Q32P28 736 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 LYSMD4Q5XG99 296 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SPOCK2Q92563 424 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 TADA1Q96BN2 335 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 BIRC7Q96CA5 298 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 FEM1CQ96JP0 617 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 VPS45Q9NRW7 570 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PQU0 124 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 A8MX80 341 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PHF2O75151 1096 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PRLP01236 227 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 CTPS1P17812 591 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 NFKBIAP25963 317 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 GEMP55040 296 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 CDK18Q07002 472 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 MPP3Q13368 585 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT3Q14435 633 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SLC14A2Q15849 920 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 CYP1B1Q16678 543 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 NEK5Q6P3R8 708 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 TTC27Q6P3X3 843 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 SUMF1Q8NBK3 374 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 IPMKQ8NFU5 416 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ATL2Q8NHH9 583 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 RMDN1Q96DB5 314 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 RNF14Q9UBS8 474 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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HOXD4-201ENST00000306324 METTL18O95568 372 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 IGHV4-34P06331 123 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 ITPKAP23677 461 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 MAOBP27338 520 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 WNT3AP56704 352 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 CREB5Q02930 508 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PARP6Q2NL67 630 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 FAXCQ5TGI0 409 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 KDELC1Q6UW63 502 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 TRIM69Q86WT6 500 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 HORMAD1Q86X24 394 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 KLK6Q92876 244 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 PHOX2BQ99453 314 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 GORASP1Q9BQQ3 440 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXD4-201ENST00000306324 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
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HOXD4-201ENST00000306324 ALPIP09923 528 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 MMP12P39900 470 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 CCR5P51681 352 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 RPL26P61254 145 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 RPS21P63220 83 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 LMNB2Q03252 620 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 PTPRRQ15256 657 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXD4-201ENST00000306324 USP45Q70EL2 814 aa22.45■■□□□ 1.18
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