RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trerf1Q8BXJ2 1205 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cnot6Q8K3P5 557 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sgpl1Q8R0X7 568 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 VitQ8VHI5 650 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mob2Q8VI63 235 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HnmtQ91VF2 295 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zdhhc7Q91WU6 308 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lysmd3Q99LE3 305 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Akirin1Q99LF1 191 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q9D454 513 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppil6Q9D6D8 278 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ddx59Q9DBN9 619 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fiz1Q9WTJ4 500 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trpc7Q9WVC5 862 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm28168A0A087WNP1 180 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcnt2D3Z649 1135 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ncam2O35136 837 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CcnfP51944 777 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aqp4P55088 323 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pfkfb2P70265 519 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ncf4P97369 339 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PhgdhQ61753 533 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zmpste24Q80W54 475 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usp1Q8BJQ2 784 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 FsbpQ8BKE5 299 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cnpy4Q8BQ47 245 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Peli3Q8BXR6 445 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ipo13Q8K0C1 963 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gsg1Q8R1W2 324 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sgsm3Q8VCZ6 750 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pip4k2cQ91XU3 421 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pcdhga10Q91XY9 930 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adam33Q923W9 797 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Def8Q99J78 448 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wfdc1Q9ESH5 211 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prmt1Q9JIF0 371 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fkbp1bQ9Z2I2 108 aa18.23■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Armt1A6H630 439 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zbed5B2RPU8 756 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pbx3O35317 434 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BhmtO35490 407 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pknox1O70477 436 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd4P06332 457 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rab17P35292 214 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hmx2P43687 273 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rnf19aP50636 840 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usp46P62069 366 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Colec11Q3SXB8 272 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam131bQ3TY60 332 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ntrk1Q3UFB7 799 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pdp2Q504M2 532 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fnip1Q68FD7 1165 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sytl5Q80T23 753 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pggt1bQ8BUY9 377 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clec1aQ8BWY2 269 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Clip4Q8CI96 704 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ankrd54Q91WK7 299 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tfap2dQ91ZK0 452 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smim11aQ99J19 55 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mtfr1Q99MB2 328 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chit1Q9D7Q1 464 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eef1akmt2Q9D853 244 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ifrd2Q9D8U0 441 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ndst3Q9EQH7 873 aa18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ttll9A2APC3 461 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm11236J3QMS7 360 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vmn2r46L7N282 809 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hcn3O88705 779 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gdf5P43027 495 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Flt3lgP49772 232 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam189bQ5HZJ5 669 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AtminQ6P9S1 818 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PolnQ7TQ07 864 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fem1cQ8CEF1 617 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 4932414N04RikQ8CEQ9 752 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SarafQ8R3Q0 334 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Olfr847Q8VFF4 312 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Krt5Q922U2 580 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc26Q99JP4 85 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dok4Q99KE3 325 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fbxo32Q9CPU7 355 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tspan11Q9D1D1 253 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Copg1Q9QZE5 874 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Skint6A7XUZ6 1240 aa18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.5 ms