RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Syde1Q9DBZ9 737 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trpc4Q9QUQ5 974 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plxna1P70206 1894 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttll8A4Q9F1 832 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FgaE9PV24 789 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930426L09RikE9Q0N7 123 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atn1O35126 1175 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CrymO54983 313 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klk1b8P07628 261 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hk1P17710 974 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccnd3P30282 292 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp2f2P33267 491 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lim2P56563 173 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NadkP58058 439 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PrkacbP68181 351 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AnpepP97449 966 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Asprv1Q09PK2 339 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Aarsd1Q3THG9 412 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc47Q505F5 581 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il15raQ60819 263 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PoliQ6R3M4 717 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mppe1Q80XL7 396 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q80Y73 168 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acsm2Q8K0L3 575 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abhd11Q8K4F5 307 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Isoc1Q91V64 297 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp617Q91WM0 559 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhb2Q91Y00 799 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rxfp2Q91ZZ5 737 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prmt7Q922X9 692 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ctu1Q99J10 420 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nudt7Q99P30 236 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NplQ9DCJ9 320 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cngb3Q9JJZ9 694 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plagl1Q9JLQ4 704 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 St6galnac1Q9QZ39 526 aa6.65□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btbd35f16A0A087WSN2 498 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl4B1AZR0 717 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FancfE9Q5Z5 343 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Il4i1O09046 630 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 KlO35082 1014 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rhox6O70238 227 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rdh7O88451 316 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnk4O88454 398 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tlx1P43345 332 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl36P47964 105 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dpf3P58269 378 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tial1P70318 392 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pou2f2Q00196 463 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mc1rQ01727 315 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tex24Q5DP50 351 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cntn4Q69Z26 1026 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dennd2cQ6P9P8 914 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rfx4Q7TNK1 735 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Samd4bQ80XS6 687 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 IfneQ80ZF2 192 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx32Q80ZJ7 404 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pnma2Q8BHK0 365 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lca5lQ8C0X0 741 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Frs2Q8C180 508 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Parp9Q8CAS9 866 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dennd1cQ8CFK6 786 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dlk2Q8K1E3 382 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Unc5aQ8K1S4 898 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp4r1Q8K2V1 951 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dclre1cQ8K4J0 705 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GrpQ8R1I2 146 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmco4Q91WU4 631 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhgc3Q91XX1 934 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DhddsQ99KU1 333 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcg3Q99P81 650 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arhgap8Q9CXP4 425 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slamf8Q9D3G2 278 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ApipQ9WVQ5 241 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm13941A2AJ38 245 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cntnap3E9PY62 1287 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kbtbd6E9PYD7 486 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r76F8VQ63 324 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kbtbd7G5E8C2 690 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm7971J3QMM8 481 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PolP11369 1281 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Svs4P18419 113 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PlaaP27612 794 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hmx2P43687 273 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 LeprP48356 1162 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspa4lP48722 838 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sult1e1P49891 295 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ArsaP50428 506 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ext2P70428 718 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sephs2P97364 452 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam83fQ3UKU4 495 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glp2rQ5IXF8 512 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Etaa1Q5SVT3 877 aa6.64□□□□□ -1.35
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rabl6Q5U3K5 725 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.6 ms