RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040676.10

Ankrd54-201, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd54, Length 1,904 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AldoaP05064 364 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cd4P06332 457 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 AlplP09242 524 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Adra2bP30545 450 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Acvr1P37172 509 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Lim2P56563 173 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sec31bQ3TZ89 1158 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Prss53Q571E5 552 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Znf689Q8BKK5 500 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Myoz3Q8R4E4 245 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tmem68Q9D850 329 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tmbim4Q9DA39 238 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Fam122aQ9DB52 284 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atp5hQ9DCX2 161 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cyth1Q9QX11 398 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 HephQ9Z0Z4 1157 aa20.9■□□□□ 0.94
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Vmn2r74E9PW21 853 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm4450E9Q007 373 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Tnfaip1O70479 316 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 LdhcP00342 332 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 CtsdP18242 410 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Npr1P18293 1057 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Aff3P51827 1254 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gpr174Q3U507 335 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Prss36Q5K2P8 849 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Hsd3b4Q61767 373 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Galnt10Q6P9S7 603 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 TdrkhQ80VL1 560 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gtf2a2Q80ZM7 109 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Psmd12Q9D8W5 456 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rbck1Q9WUB0 508 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pcm1Q9R0L6 2025 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Kiaa0100Q5SYL3 2234 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 PtprdQ64487 1912 aa20.89■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sp1O89090 784 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 P01669 111 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 CenpcP49452 906 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Itih1Q61702 907 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Atg10Q8R1P4 215 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cadm1Q8R5M8 456 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Zfp566Q8VCI1 386 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cwh43Q91YL7 699 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc13a1Q9JHI4 594 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gria4Q9Z2W8 902 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Igkv18-36A0A075B5M9 114 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cilp2D3Z7H8 1162 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nsmce4aG3XA30 381 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm20828J3KMI7 228 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Vmn2r10K7N621 847 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Per3O70361 1113 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 TertO70372 1122 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Igf2bp1O88477 577 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Mcpt1P11034 246 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cxcr2P35343 359 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Hmx2P43687 273 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Matn1P51942 500 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ceacam5Q3UKK2 947 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 ChukQ60680 745 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ssxb3Q6XAS4 170 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 RfflQ6ZQM0 377 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Olfr213Q7TS32 327 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 R3hcc1lQ8BJM3 775 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slc9a7Q8BLV3 726 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Q8C5S3 137 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rgs10Q9CQE5 181 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ppil6Q9D6D8 278 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ptpn4Q9WU22 926 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Scn5aQ9JJV9 2019 aa20.88■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Adamts8P57110 905 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ctps2P70303 586 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nat9Q3UG98 241 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gm8773Q3UQ24 132 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Slfn4Q3UV66 602 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nxpe4Q52KP5 543 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Brsk1Q5RJI5 778 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Grik1Q60934 836 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Gpr19Q61121 415 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Dlx3Q64205 287 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 FsbpQ8BKE5 299 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Rap2cQ8BU31 183 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Adprhl2Q8CG72 370 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Klhl2Q8JZP3 593 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Sgpl1Q8R0X7 568 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Taf12Q8VE65 161 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Olfr1353Q8VGU8 309 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cldn22Q9D7U6 220 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Q9D937 123 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Ndst3Q9EQH7 873 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cldn19Q9ET38 224 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cog8Q9JJA2 640 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Nt5cQ9JM14 200 aa20.87■□□□□ 0.93
Ankrd54-201ENSMUST00000040676 Cldn3Q9Z0G9 219 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.8 ms