RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Parp12Q8BZ20 711 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TpbglQ8C013 384 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AcppQ8CE08 381 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BroxQ8K2Q7 411 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr385Q8VGT1 312 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem246Q91YV9 403 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Shmt2Q9CZN7 504 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnajb4Q9D832 337 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Syde1Q9DBZ9 737 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RhojQ9ER71 214 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plod3Q9R0E1 741 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ArntlQ9WTL8 632 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa10.01□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6509A0A0J9YUV1 481 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm6351K9J7D1 481 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GhrP16882 650 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ap2a1P17426 977 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fscn2Q32M02 492 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Secisbp2Q3U1C4 858 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Defa17Q64016 82 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pabpc5Q8C7D3 381 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ints10Q8K2A7 710 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ManbaQ8K2I4 879 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akr1c14Q91WT7 323 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slco1a5Q91YY5 670 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rgs18Q99PG4 235 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifitm3Q9CQW9 137 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spcs2Q9CYN2 226 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3404Q9D506 307 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TrirQ9D735 173 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q9DAD0 168 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il23aQ9EQ14 196 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Apba3O88888 571 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Samd12Q0VE29 161 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cpne9Q1RLL3 553 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Naf1Q3UMQ8 489 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vps51Q3UVL4 782 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myo1dQ5SYD0 1006 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Khdrbs1Q60749 443 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q6P2K3 674 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HjurpQ6PG16 667 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1252Q7TQZ2 314 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1057Q7TR75 315 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem154Q8C4Q9 181 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dennd1cQ8CFK6 786 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prpf39Q8K2Z2 665 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Angptl7Q8R1Q3 337 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttc39cQ8VE09 580 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1361Q8VFH0 317 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 L2hgdhQ91YP0 464 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bbox1Q924Y0 387 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim33Q99PP7 1142 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plpp6Q9D4F2 292 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam122aQ9DB52 284 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nme3Q9WV85 169 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HephQ9Z0Z4 1157 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Col4a3Q9QZS0 1669 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atad5Q4QY64 1826 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcdh7A0A0A6YY83 1255 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2j12G3UXT0 502 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gml2G5E8L7 176 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MafgO54790 162 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnni3P48787 211 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gabpb1Q00420 383 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ubxn2bQ0KL01 331 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmc5Q32NZ6 967 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifi47Q61635 420 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adamts16Q69Z28 1222 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp341Q6PGC9 846 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ChfrQ810L3 664 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc16a12Q8BGC3 486 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kank2Q8BX02 843 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TbcdQ8BYA0 1196 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r198Q8R263 300 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CpzQ8R4V4 654 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alas1Q8VC19 642 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tas1r3Q925D8 858 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smim11aQ99J19 55 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PclafQ9CQX4 110 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GrapQ9CX99 217 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slco1a4Q9EP96 670 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AnkhQ9JHZ2 492 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trpv2Q9WTR1 756 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bcl10Q9Z0H7 233 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ambra1A2AH22 1300 aa10□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myo18aQ9JMH9 2050 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r2A2AMT6 306 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eno2P17183 434 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eno3P21550 434 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il12aP43431 215 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufs6P52503 116 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PrkcgP63318 697 aa9.99□□□□□ -0.81
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PrkcbP68404 671 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.1 ms