RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-M10.5Q85ZW7 330 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmtc4Q8BG19 741 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bola2Q8BGS2 86 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Enpp4Q8BTJ4 456 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr26Q8C6G8 641 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fem1cQ8CEF1 617 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ipo11Q8K2V6 975 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxw7Q8VBV4 629 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab7bQ8VEA8 199 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcg4Q91WA9 646 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bcl7aQ9CXE2 210 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm9817Q9D2M0 144 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dus2Q9D7B1 493 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plscr1Q9JJ00 328 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Syt10Q9R0N4 523 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam24Q9R160 761 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sec16aA2AIX1 2377 aa11.27□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 6720489N17RikA0A1Y7VJW0 127 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Syndig1A2ANU3 258 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3298E9PW80 205 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20390E9PZF0 267 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 BC024978J3QPC3 361 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Soat2O88908 525 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HnrnpkP61979 463 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Neurog2P70447 263 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nme2Q01768 152 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B3gnt4Q1RLK6 350 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hdgfl1Q2VPR5 283 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zmym1Q3TJB1 983 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fzd4Q61088 537 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Six4Q61321 775 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sin3bQ62141 1098 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbccd1Q640P7 552 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mettl25Q6NXH8 597 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taf1cQ6PDZ2 836 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8BGK9 164 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf770Q8BIQ8 705 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hs3st3a1Q8BKN6 393 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr398Q8VFY0 314 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr459Q924H8 314 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam69bQ99ML4 431 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc26a5Q99NH7 744 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mfap3lQ9D3X9 409 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc91Q9D8L5 442 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bbs10Q9DBI2 713 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prl2a1Q9JHK0 228 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stk4Q9JI11 487 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Col4a2P08122 1707 aa11.26□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Muc5acE9QAQ8 3455 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrk2Q5S006 2527 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbf1A2A870 1173 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stpg3A2RSX4 306 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf39A2RT81 352 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DgkiD3YWQ0 1071 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6205E9PZS2 359 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r88L7N1W8 857 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ByslO54825 436 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atxn2O70305 1285 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rasgrf1P27671 1262 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gna15P30678 374 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cxcr2P35343 359 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PorP37040 678 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MatkP41242 505 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arl4aP61213 200 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ThraP63058 492 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adcy5P84309 1262 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mmp7Q10738 264 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CenplQ3U3S3 329 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxw2Q60584 422 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Krt32Q62168 407 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vat1Q62465 406 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp1b1Q64429 543 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf187Q8BFX1 236 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf574Q8BY46 900 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bpifb2Q8C1E1 462 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sfrp1Q8C4U3 314 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6367Q8C6L9 287 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gbp5Q8CFB4 590 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P3h2Q8CG71 703 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kdm1bQ8CIG3 826 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spp2Q8K1I3 203 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr589Q8VGV8 317 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem98Q91X86 226 aa11.25□□□□□ -0.61
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.6 ms