RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LTN1O94822 1766 aa8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TONSLQ96HA7 1378 aa8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.43□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.42□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.42□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.41□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.41□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.41□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.41□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PARD3Q8TEW0 1356 aa8.41□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDB1Q16531 1140 aa8.41□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABCC6O95255 1503 aa8.4□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.4□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NME9Q86XW9 330 aa8.4□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMC1Q8TDI8 760 aa8.4□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.4□□□□□ -1.06
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USP31Q70CQ4 1352 aa8.39□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.39□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.39□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 A0A1W2PP64 1363 aa8.38□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NHSQ6T4R5 1651 aa8.37□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ERBB3P21860 1342 aa8.37□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NBPF14Q5TI25 921 aa8.37□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TESK2Q96S53 571 aa8.37□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TNS2Q63HR2 1409 aa8.37□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC7Q96M83 1385 aa8.36□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CASZ1Q86V15 1759 aa8.36□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa8.36□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EXOC5O00471 708 aa8.36□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLSCR1O15162 318 aa8.36□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.36□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BCL9O00512 1426 aa8.36□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.35□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PROM2Q8N271 834 aa8.35□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANKRD24Q8TF21 1146 aa8.35□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.35□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KCNQ2O43526 872 aa8.34□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NINLQ9Y2I6 1382 aa8.34□□□□□ -1.07
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BTAF1O14981 1849 aa8.33□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IL2RBP14784 551 aa8.33□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBLN1P23142 703 aa8.33□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TXNRD1Q16881 649 aa8.33□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.33□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SHANK3Q9BYB0 1731 aa8.33□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.33□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.32□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IP6K1Q92551 441 aa8.32□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SPON1Q9HCB6 807 aa8.32□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MYOM1P52179 1685 aa8.32□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USP47Q96K76 1375 aa8.32□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PAPPAQ13219 1627 aa8.32□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.32□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAP3K19Q56UN5 1328 aa8.31□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 COG3Q96JB2 828 aa8.31□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC24A1O60721 1099 aa8.3□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HOXC9P31274 260 aa8.3□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMF1P82094 1093 aa8.3□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FYB1O15117 783 aa8.29□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZBTB7AO95365 584 aa8.29□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 AMPHP49418 695 aa8.29□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC15A2Q16348 729 aa8.29□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.29□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STK32BQ9NY57 414 aa8.29□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MEGF6O75095 1541 aa8.29□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LY75O60449 1722 aa8.28□□□□□ -1.08
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa8.27□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RTL1A6NKG5 1358 aa8.27□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.27□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PTGER2P43116 358 aa8.27□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.27□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NSD2O96028 1365 aa8.26□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF827Q17R98 1081 aa8.26□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NBPF6Q5VWK0 638 aa8.26□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 USHBP1Q8N6Y0 703 aa8.26□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NBPF4Q96M43 638 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms