RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637667.1

CLN6-222, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLN6, Length 874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-222ENST00000637667 USP31Q70CQ4 1352 aa28.37■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 NFAT5O94916 1531 aa28.37■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 APBA3O96018 575 aa28.36■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 NME9Q86XW9 330 aa28.36■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 TESK2Q96S53 571 aa28.36■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.35■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
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CLN6-222ENST00000637667 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.35■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.35■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.33■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
CLN6-222ENST00000637667 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.32■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 DDB1Q16531 1140 aa28.31■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 A0A1W2PP64 1363 aa28.31■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.31■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 SLC24A1O60721 1099 aa28.29■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 ABCC6O95255 1503 aa28.28■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.28■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.28■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.28■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.28■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 USP54Q70EL1 1684 aa28.26■■■□□ 2.12
CLN6-222ENST00000637667 LRRC37A3O60309 1634 aa28.25■■■□□ 2.11
CLN6-222ENST00000637667 RGPD5Q99666 1765 aa28.24■■■□□ 2.11
CLN6-222ENST00000637667 CCDC7Q96M83 1385 aa28.24■■■□□ 2.11
CLN6-222ENST00000637667 USP47Q96K76 1375 aa28.23■■■□□ 2.11
CLN6-222ENST00000637667 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CLN6-222ENST00000637667 PEAK1Q9H792 1746 aa28.22■■■□□ 2.11
CLN6-222ENST00000637667 ERBB3P21860 1342 aa28.21■■■□□ 2.11
CLN6-222ENST00000637667 LRP5O75197 1615 aa28.2■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.18■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 TMF1P82094 1093 aa28.18■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.18■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 BCL9O00512 1426 aa28.18■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 EXOC5O00471 708 aa28.17■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.16■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.15■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 NBPF14Q5TI25 921 aa28.15■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 RREB1Q92766 1687 aa28.15■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.14■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 COG3Q96JB2 828 aa28.14■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.14■■■□□ 2.1
CLN6-222ENST00000637667 TNS2Q63HR2 1409 aa28.13■■■□□ 2.09
CLN6-222ENST00000637667 LTN1O94822 1766 aa28.13■■■□□ 2.09
CLN6-222ENST00000637667 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.13■■■□□ 2.09
CLN6-222ENST00000637667 PLSCR1O15162 318 aa28.12■■■□□ 2.09
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CLN6-222ENST00000637667 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.12■■■□□ 2.09
CLN6-222ENST00000637667 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.11■■■□□ 2.09
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CLN6-222ENST00000637667 SBF2Q86WG5 1849 aa28.1■■■□□ 2.09
CLN6-222ENST00000637667 CDCA8Q53HL2 280 aa28.09■■■□□ 2.09
CLN6-222ENST00000637667 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.08■■■□□ 2.09
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CLN6-222ENST00000637667 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.04■■■□□ 2.08
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CLN6-222ENST00000637667 AMPHP49418 695 aa28.04■■■□□ 2.08
CLN6-222ENST00000637667 HOXC9P31274 260 aa28.03■■■□□ 2.08
CLN6-222ENST00000637667 PROM2Q8N271 834 aa28.02■■■□□ 2.08
CLN6-222ENST00000637667 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.02■■■□□ 2.08
CLN6-222ENST00000637667 KCNQ2O43526 872 aa28.01■■■□□ 2.07
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CLN6-222ENST00000637667 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
CLN6-222ENST00000637667 RTL1A6NKG5 1358 aa27.98■■■□□ 2.07
CLN6-222ENST00000637667 TXNRD1Q16881 649 aa27.97■■■□□ 2.07
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CLN6-222ENST00000637667 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
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CLN6-222ENST00000637667 STK32BQ9NY57 414 aa27.89■■■□□ 2.06
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CLN6-222ENST00000637667 NBPF4Q96M43 638 aa27.88■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 MYOM1P52179 1685 aa27.87■■■□□ 2.05
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CLN6-222ENST00000637667 MEGF6O75095 1541 aa27.86■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 INSRP06213 1382 aa27.86■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 FLT4P35916 1363 aa27.86■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.85■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 SLC15A2Q16348 729 aa27.85■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.85■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.85■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.84■■■□□ 2.05
CLN6-222ENST00000637667 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.82■■■□□ 2.04
CLN6-222ENST00000637667 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.82■■■□□ 2.04
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