RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-215	ENST00000628018	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CAPNS1-215	ENST00000628018	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF521	Q96K83	1311 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CAPNS1-215	ENST00000628018	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CAPNS1-215	ENST00000628018	IP6K1	Q92551	441 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CAPNS1-215	ENST00000628018	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
CAPNS1-215	ENST00000628018	HMOX1	P09601	288 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		32.82	■■■□□ 2.85
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLEKHG5	O94827	1062 aa		32.82	■■■□□ 2.85
CAPNS1-215	ENST00000628018	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.82	■■■□□ 2.85
CAPNS1-215	ENST00000628018	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
CAPNS1-215	ENST00000628018	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC27	Q2M243	656 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-215	ENST00000628018	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-215	ENST00000628018	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		32.78	■■■□□ 2.84
CAPNS1-215	ENST00000628018	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-215	ENST00000628018	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-215	ENST00000628018	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-215	ENST00000628018	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	NEUROD2	Q15784	382 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	WWC1	Q8IX03	1113 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	EYA1	Q99502	592 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	TOM1	O60784	492 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	NEFM	P07197	916 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	KDR	P35968	1356 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	GOLGA2	Q08379	1002 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	CPD	O75976	1380 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	COL18A1	P39060	1754 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	ABCC6	O95255	1503 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CAPNS1-215	ENST00000628018	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	RIPK4	P57078	832 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLFN5	Q08AF3	891 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	NFE2L2	Q16236	605 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	RGPD5	Q99666	1765 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	WDR63	Q8IWG1	891 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	KIAA0232	Q92628	1395 aa		32.65	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	32.64	■■■□□ 2.82
CAPNS1-215	ENST00000628018	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018		E9PSI1	815 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	NBPF4	Q96M43	638 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	NCAPD2	Q15021	1401 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	ERBB3	P21860	1342 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	CHRNA2	Q15822	529 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-215	ENST00000628018	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		32.57	■■■□□ 2.8
CAPNS1-215	ENST00000628018	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CAPNS1-215	ENST00000628018	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CAPNS1-215	ENST00000628018	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
CAPNS1-215	ENST00000628018	IL16	Q14005	1332 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CAPNS1-215	ENST00000628018	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		32.53	■■■□□ 2.8
CAPNS1-215	ENST00000628018	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
CAPNS1-215	ENST00000628018	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.49	■■■□□ 2.79
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CAPNS1-215	ENST00000628018	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		32.47	■■■□□ 2.79
CAPNS1-215	ENST00000628018	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.45	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	FAM83G	A6ND36	823 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		32.43	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.41	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	DCTN1	Q14203	1278 aa		32.4	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	32.39	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	NEFL	P07196	543 aa		32.39	■■■□□ 2.78
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF853	P0CG23	659 aa		32.37	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	IFT57	Q9NWB7	429 aa		32.37	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.36	■■■□□ 2.77
CAPNS1-215	ENST00000628018	MCM10	Q7L590	875 aa		32.36	■■■□□ 2.77

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