RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621817.1

FAM58A-209, Transcript of Cyclin-related protein FAM58A, human

TSL 3

Gene FAM58A, Length 916 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM58A-209	ENST00000621817	TMC1	Q8TDI8	760 aa		40.92	■■■■■ 4.14
FAM58A-209	ENST00000621817	BAG6	P46379	1132 aa		40.91	■■■■■ 4.14
FAM58A-209	ENST00000621817	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		40.9	■■■■■ 4.14
FAM58A-209	ENST00000621817	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	40.9	■■■■■ 4.14
FAM58A-209	ENST00000621817	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
FAM58A-209	ENST00000621817	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		40.89	■■■■■ 4.14
FAM58A-209	ENST00000621817	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		40.88	■■■■■ 4.14
FAM58A-209	ENST00000621817	LRRC37A3	O60309	1634 aa		40.87	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	NME9	Q86XW9	330 aa		40.87	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		40.86	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	SOX12	O15370	315 aa		40.85	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	SLC24A1	O60721	1099 aa		40.85	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		40.85	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	USP47	Q96K76	1375 aa		40.85	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	PDE3B	Q13370	1112 aa		40.84	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	PEAK1	Q9H792	1746 aa		40.84	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	LTN1	O94822	1766 aa		40.84	■■■■■ 4.13
FAM58A-209	ENST00000621817	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		40.82	■■■■■ 4.12
FAM58A-209	ENST00000621817	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		40.82	■■■■■ 4.12
FAM58A-209	ENST00000621817	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		40.81	■■■■■ 4.12
FAM58A-209	ENST00000621817	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		40.81	■■■■■ 4.12
FAM58A-209	ENST00000621817	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	40.8	■■■■■ 4.12
FAM58A-209	ENST00000621817	TRIM37	O94972	964 aa		40.79	■■■■■ 4.12
FAM58A-209	ENST00000621817	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		40.75	■■■■■ 4.11
FAM58A-209	ENST00000621817	SBF2	Q86WG5	1849 aa		40.73	■■■■■ 4.11
FAM58A-209	ENST00000621817	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		40.71	■■■■■ 4.11
FAM58A-209	ENST00000621817	RREB1	Q92766	1687 aa		40.71	■■■■■ 4.11
FAM58A-209	ENST00000621817	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		40.7	■■■■■ 4.11
FAM58A-209	ENST00000621817	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		40.7	■■■■■ 4.11
FAM58A-209	ENST00000621817	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		40.7	■■■■■ 4.11
FAM58A-209	ENST00000621817	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	40.69	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	TMF1	P82094	1093 aa		40.68	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	DDB1	Q16531	1140 aa		40.68	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		40.68	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	CCDC7	Q96M83	1385 aa		40.67	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	ERBB3	P21860	1342 aa		40.67	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		40.66	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	APBA3	O96018	575 aa		40.65	■■■■■ 4.1
FAM58A-209	ENST00000621817	BCL9	O00512	1426 aa		40.62	■■■■■ 4.09
FAM58A-209	ENST00000621817	LRP5	O75197	1615 aa		40.62	■■■■■ 4.09
FAM58A-209	ENST00000621817	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		40.62	■■■■■ 4.09
FAM58A-209	ENST00000621817	MYOM1	P52179	1685 aa		40.59	■■■■■ 4.09
FAM58A-209	ENST00000621817	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
FAM58A-209	ENST00000621817	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		40.59	■■■■■ 4.09
FAM58A-209	ENST00000621817	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
FAM58A-209	ENST00000621817	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
FAM58A-209	ENST00000621817	TNS2	Q63HR2	1409 aa		40.56	■■■■■ 4.08
FAM58A-209	ENST00000621817	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
FAM58A-209	ENST00000621817	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		40.54	■■■■■ 4.08
FAM58A-209	ENST00000621817	COG3	Q96JB2	828 aa		40.54	■■■■■ 4.08
FAM58A-209	ENST00000621817	CDCA8	Q53HL2	280 aa		40.53	■■■■■ 4.08
FAM58A-209	ENST00000621817	IP6K1	Q92551	441 aa		40.53	■■■■■ 4.08
FAM58A-209	ENST00000621817	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		40.51	■■■■■ 4.07
FAM58A-209	ENST00000621817	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		40.5	■■■■■ 4.07
FAM58A-209	ENST00000621817	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		40.48	■■■■■ 4.07
FAM58A-209	ENST00000621817	EXOC5	O00471	708 aa		40.48	■■■■■ 4.07
FAM58A-209	ENST00000621817	FYB1	O15117	783 aa		40.48	■■■■■ 4.07
FAM58A-209	ENST00000621817	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
FAM58A-209	ENST00000621817	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		40.46	■■■■■ 4.07
FAM58A-209	ENST00000621817	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
FAM58A-209	ENST00000621817	FBLN1	P23142	703 aa		40.44	■■■■■ 4.06
FAM58A-209	ENST00000621817	PLSCR1	O15162	318 aa		40.42	■■■■■ 4.06
FAM58A-209	ENST00000621817	IL2RB	P14784	551 aa		40.42	■■■■■ 4.06
FAM58A-209	ENST00000621817	HOXC9	P31274	260 aa		40.41	■■■■■ 4.06
FAM58A-209	ENST00000621817	RTL1	A6NKG5	1358 aa		40.4	■■■■■ 4.06
FAM58A-209	ENST00000621817	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		40.4	■■■■■ 4.06
FAM58A-209	ENST00000621817	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		40.4	■■■■■ 4.06
FAM58A-209	ENST00000621817	NHS	Q6T4R5	1651 aa		40.4	■■■■■ 4.06
FAM58A-209	ENST00000621817	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		40.38	■■■■■ 4.05
FAM58A-209	ENST00000621817	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	40.35	■■■■■ 4.05
FAM58A-209	ENST00000621817	AMPH	P49418	695 aa		40.33	■■■■■ 4.05
FAM58A-209	ENST00000621817	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
FAM58A-209	ENST00000621817	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		40.33	■■■■■ 4.05
FAM58A-209	ENST00000621817	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.05
FAM58A-209	ENST00000621817	NBPF14	Q5TI25	921 aa		40.31	■■■■■ 4.04
FAM58A-209	ENST00000621817	PROM2	Q8N271	834 aa		40.29	■■■■■ 4.04
FAM58A-209	ENST00000621817	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		40.28	■■■■■ 4.04
FAM58A-209	ENST00000621817	KCNQ2	O43526	872 aa		40.27	■■■■■ 4.04
FAM58A-209	ENST00000621817	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		40.24	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	BTAF1	O14981	1849 aa		40.24	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		40.24	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	40.23	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	INSR	P06213	1382 aa		40.22	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	MEGF6	O75095	1541 aa		40.21	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	40.21	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	40.21	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		40.2	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	FLT4	P35916	1363 aa		40.2	■■■■■ 4.03
FAM58A-209	ENST00000621817	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		40.19	■■■■■ 4.02
FAM58A-209	ENST00000621817	CASZ1	Q86V15	1759 aa		40.18	■■■■■ 4.02
FAM58A-209	ENST00000621817	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		40.18	■■■■■ 4.02
FAM58A-209	ENST00000621817	NBPF4	Q96M43	638 aa		40.18	■■■■■ 4.02
FAM58A-209	ENST00000621817	TXNRD1	Q16881	649 aa		40.17	■■■■■ 4.02
FAM58A-209	ENST00000621817	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		40.16	■■■■■ 4.02
FAM58A-209	ENST00000621817	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
FAM58A-209	ENST00000621817	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		40.14	■■■■■ 4.02
FAM58A-209	ENST00000621817	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.01
FAM58A-209	ENST00000621817	PAPPA	Q13219	1627 aa		40.12	■■■■■ 4.01

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