RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597330.1

LETM1P2-201, Transcript of leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene LETM1P2, Length 2,178 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1P2-201ENST00000597330 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.96■■□□□ 1.27
LETM1P2-201ENST00000597330 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 WDR63Q8IWG1 891 aa22.95■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.94■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 RUNDC1Q96C34 613 aa22.93■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.93■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.93■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.93■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.93■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.92■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.92■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.91■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.91■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.91■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 MCTP1Q6DN14 999 aa22.9■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.9■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 NUCB2P80303 420 aa22.89■■□□□ 1.26
LETM1P2-201ENST00000597330 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.89■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.88■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 CCDC27Q2M243 656 aa22.87■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.87■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 MORC1Q86VD1 984 aa22.87■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 KIF16BQ96L93 1317 aa22.87■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 ZFYVE9O95405 1425 aa22.87■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.87■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.87■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.87■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 NUCB1Q02818 461 aa22.86■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 TAF3Q5VWG9 929 aa22.86■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.86■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.86■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 CBX1P83916 185 aa22.84■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 NEUROD2Q15784 382 aa22.83■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
LETM1P2-201ENST00000597330 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.83■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 ATP2B3Q16720 1220 aa22.8■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 GPT2Q8TD30 523 aa22.8■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 CFAP53Q96M91 514 aa22.8■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.8■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.79■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 PTPRMP28827 1452 aa22.79■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.79■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.79■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 TMEM51Q9NW97 253 aa22.79■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 USP32Q8NFA0 1604 aa22.78■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 TRIM27P14373 513 aa22.77■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.77■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.77■■□□□ 1.24
LETM1P2-201ENST00000597330 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.76■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 LNPKQ9C0E8 428 aa22.76■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 RABEP1Q15276 862 aa22.76■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.76■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.76■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.76■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 KIF3AQ9Y496 699 aa22.76■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 ADGRB2O60241 1585 aa22.75■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 SYCE3A1L190 88 aa22.74■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 MTHFSP49914 203 aa22.74■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.74■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 ADGRB1O14514 1584 aa22.74■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.73■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 TSC1Q92574 1164 aa22.73■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.72■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 MBD3O95983 291 aa22.72■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 ALKQ9UM73 1620 aa22.71■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.71■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 LTKP29376 864 aa22.7■■□□□ 1.23
LETM1P2-201ENST00000597330 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.6 ms