RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597316.1

TRPM4-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRPM4, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM4-208ENST00000597316 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.18■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.18■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.17■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 PROM2Q8N271 834 aa25.17■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.17■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.15■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 EXOC5O00471 708 aa25.15■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.15■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 BCL9O00512 1426 aa25.14■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 SOX12O15370 315 aa25.14■■□□□ 1.62
TRPM4-208ENST00000597316 PEAK1Q9H792 1746 aa25.14■■□□□ 1.61
TRPM4-208ENST00000597316 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TRPM4-208ENST00000597316 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.12■■□□□ 1.61
TRPM4-208ENST00000597316 ZBTB7AO95365 584 aa25.11■■□□□ 1.61
TRPM4-208ENST00000597316 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TRPM4-208ENST00000597316 STK32BQ9NY57 414 aa25.11■■□□□ 1.61
TRPM4-208ENST00000597316 LRRC37A3O60309 1634 aa25.11■■□□□ 1.61
TRPM4-208ENST00000597316 TXNRD1Q16881 649 aa25.1■■□□□ 1.61
TRPM4-208ENST00000597316 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.1■■□□□ 1.61
TRPM4-208ENST00000597316 SLC15A2Q16348 729 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 COL18A1P39060 1754 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 PIK3C2AO00443 1686 aa25.07■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 CCDC7Q96M83 1385 aa25.06■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 PTGER2P43116 358 aa25.06■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 SBF2Q86WG5 1849 aa25.04■■□□□ 1.6
TRPM4-208ENST00000597316 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.01■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 MTFR1LQ9H019 292 aa25.01■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 NEUROD1Q13562 356 aa24.99■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.99■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 SYT17Q9BSW7 474 aa24.99■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.99■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 CASZ1Q86V15 1759 aa24.98■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 TNS2Q63HR2 1409 aa24.97■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 NFAT5O94916 1531 aa24.96■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 IL2RBP14784 551 aa24.96■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 USP31Q70CQ4 1352 aa24.95■■□□□ 1.59
TRPM4-208ENST00000597316 ERBB3P21860 1342 aa24.95■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.93■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 AKAP12Q02952 1782 aa24.93■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 ABCC6O95255 1503 aa24.93■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 NME9Q86XW9 330 aa24.93■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.93■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 TMC1Q8TDI8 760 aa24.92■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.92■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 RGPD5Q99666 1765 aa24.91■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 ARXQ96QS3 562 aa24.91■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 UTRNP46939 3433 aa24.9■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 MYOM1P52179 1685 aa24.89■■□□□ 1.58
TRPM4-208ENST00000597316 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.89■■□□□ 1.57
TRPM4-208ENST00000597316 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.87■■□□□ 1.57
TRPM4-208ENST00000597316 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.87■■□□□ 1.57
TRPM4-208ENST00000597316 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.86■■□□□ 1.57
TRPM4-208ENST00000597316 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.85■■□□□ 1.57
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF827Q17R98 1081 aa24.84■■□□□ 1.57
TRPM4-208ENST00000597316 NHSQ6T4R5 1651 aa24.83■■□□□ 1.57
TRPM4-208ENST00000597316 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TRPM4-208ENST00000597316 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.83■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.82■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.82■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 IP6K1Q92551 441 aa24.82■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 MAP3K5Q99683 1374 aa24.81■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 AKT1S1Q96B36 256 aa24.8■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.8■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 GPR162Q16538 588 aa24.79■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 POLD1P28340 1107 aa24.78■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRPM4-208ENST00000597316 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.76■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 A0A1W2PP64 1363 aa24.76■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 PAPPAQ13219 1627 aa24.75■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 USP54Q70EL1 1684 aa24.75■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 KLHL34Q8N239 644 aa24.74■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.73■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 C1QTNF8P60827 252 aa24.73■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 COG3Q96JB2 828 aa24.73■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 BTAF1O14981 1849 aa24.72■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 AMPHP49418 695 aa24.71■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 KCNQ4P56696 695 aa24.71■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 LTN1O94822 1766 aa24.71■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.7■■□□□ 1.55
TRPM4-208ENST00000597316 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.7■■□□□ 1.54
TRPM4-208ENST00000597316 HOXC9P31274 260 aa24.7■■□□□ 1.54
TRPM4-208ENST00000597316 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.69■■□□□ 1.54
TRPM4-208ENST00000597316 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TRPM4-208ENST00000597316 SLC24A1O60721 1099 aa24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms