RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595594.1

FCHO1-210, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-210ENST00000595594 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.31■■□□□ 1.8
FCHO1-210ENST00000595594 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.3■■□□□ 1.8
FCHO1-210ENST00000595594 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
FCHO1-210ENST00000595594 NFAT5O94916 1531 aa26.29■■□□□ 1.8
FCHO1-210ENST00000595594 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.28■■□□□ 1.8
FCHO1-210ENST00000595594 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.28■■□□□ 1.8
FCHO1-210ENST00000595594 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.27■■□□□ 1.8
FCHO1-210ENST00000595594 DDB1Q16531 1140 aa26.27■■□□□ 1.8
FCHO1-210ENST00000595594 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 TMC1Q8TDI8 760 aa26.26■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 LTN1O94822 1766 aa26.25■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 CD163L1Q9NR16 1453 aa26.25■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 TONSLQ96HA7 1378 aa26.25■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 NME9Q86XW9 330 aa26.24■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.22■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.22■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
FCHO1-210ENST00000595594 USP54Q70EL1 1684 aa26.2■■□□□ 1.78
FCHO1-210ENST00000595594 CARD10Q9BWT7 1032 aa26.19■■□□□ 1.78
FCHO1-210ENST00000595594 NBPF14Q5TI25 921 aa26.18■■□□□ 1.78
FCHO1-210ENST00000595594 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
FCHO1-210ENST00000595594 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.17■■□□□ 1.78
FCHO1-210ENST00000595594 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
FCHO1-210ENST00000595594 USP31Q70CQ4 1352 aa26.16■■□□□ 1.78
FCHO1-210ENST00000595594 A0A1W2PP64 1363 aa26.14■■□□□ 1.78
FCHO1-210ENST00000595594 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 ABCC6O95255 1503 aa26.13■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 EXOC5O00471 708 aa26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 CCDC7Q96M83 1385 aa26.1■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.1■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 TNS2Q63HR2 1409 aa26.09■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.09■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 PLSCR1O15162 318 aa26.09■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.09■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 ERBB3P21860 1342 aa26.09■■□□□ 1.77
FCHO1-210ENST00000595594 PROM2Q8N271 834 aa26.07■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.07■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 TESK2Q96S53 571 aa26.07■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 CASZ1Q86V15 1759 aa26.06■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 KCNQ2O43526 872 aa26.06■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.06■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 NHSQ6T4R5 1651 aa26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 BCL9O00512 1426 aa26.05■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.04■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 FBLN1P23142 703 aa26.03■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 SPON1Q9HCB6 807 aa26.02■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
FCHO1-210ENST00000595594 BTAF1O14981 1849 aa26.01■■□□□ 1.75
FCHO1-210ENST00000595594 IL2RBP14784 551 aa26.01■■□□□ 1.75
FCHO1-210ENST00000595594 TXNRD1Q16881 649 aa26.01■■□□□ 1.75
FCHO1-210ENST00000595594 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
FCHO1-210ENST00000595594 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
FCHO1-210ENST00000595594 ZBTB7AO95365 584 aa25.97■■□□□ 1.75
FCHO1-210ENST00000595594 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
FCHO1-210ENST00000595594 IP6K1Q92551 441 aa25.96■■□□□ 1.75
FCHO1-210ENST00000595594 COG3Q96JB2 828 aa25.95■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.94■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 MYOM1P52179 1685 aa25.94■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 STK32BQ9NY57 414 aa25.94■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.94■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 USP47Q96K76 1375 aa25.93■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 HOXC9P31274 260 aa25.91■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 AMPHP49418 695 aa25.91■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 SLC15A2Q16348 729 aa25.91■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.91■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.91■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.91■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.9■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
FCHO1-210ENST00000595594 PAPPAQ13219 1627 aa25.88■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.88■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 TMF1P82094 1093 aa25.88■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 PTGER2P43116 358 aa25.85■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.85■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 MEGF6O75095 1541 aa25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 FYB1O15117 783 aa25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF827Q17R98 1081 aa25.83■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
FCHO1-210ENST00000595594 SLC24A1O60721 1099 aa25.82■■□□□ 1.72
FCHO1-210ENST00000595594 KCNQ4P56696 695 aa25.81■■□□□ 1.72
FCHO1-210ENST00000595594 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.81■■□□□ 1.72
FCHO1-210ENST00000595594 YY1P25490 414 aa25.8■■□□□ 1.72
FCHO1-210ENST00000595594 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.8■■□□□ 1.72
FCHO1-210ENST00000595594 NBPF4Q96M43 638 aa25.8■■□□□ 1.72
FCHO1-210ENST00000595594 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms