RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593111.1

PSME3-216, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene PSME3, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-216ENST00000593111 KCNQ2O43526 872 aa25.02■■□□□ 1.6
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PSME3-216ENST00000593111 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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PSME3-216ENST00000593111 PTF1AQ7RTS3 328 aa25■■□□□ 1.59
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PSME3-216ENST00000593111 COL18A1P39060 1754 aa25■■□□□ 1.59
PSME3-216ENST00000593111 PEAK1Q9H792 1746 aa24.99■■□□□ 1.59
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PSME3-216ENST00000593111 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.96■■□□□ 1.59
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PSME3-216ENST00000593111 AKAP12Q02952 1782 aa24.92■■□□□ 1.58
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PSME3-216ENST00000593111 CCDC7Q96M83 1385 aa24.88■■□□□ 1.57
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PSME3-216ENST00000593111 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.87■■□□□ 1.57
PSME3-216ENST00000593111 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.86■■□□□ 1.57
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PSME3-216ENST00000593111 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.85■■□□□ 1.57
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PSME3-216ENST00000593111 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
PSME3-216ENST00000593111 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.83■■□□□ 1.57
PSME3-216ENST00000593111 SLC15A2Q16348 729 aa24.82■■□□□ 1.56
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PSME3-216ENST00000593111 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.81■■□□□ 1.56
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PSME3-216ENST00000593111 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.79■■□□□ 1.56
PSME3-216ENST00000593111 IL2RBP14784 551 aa24.79■■□□□ 1.56
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PSME3-216ENST00000593111 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
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PSME3-216ENST00000593111 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.65■■□□□ 1.54
PSME3-216ENST00000593111 BTAF1O14981 1849 aa24.65■■□□□ 1.54
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PSME3-216ENST00000593111 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.64■■□□□ 1.54
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PSME3-216ENST00000593111 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PSME3-216ENST00000593111 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.61■■□□□ 1.53
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PSME3-216ENST00000593111 PAPPAQ13219 1627 aa24.57■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 SLC24A1O60721 1099 aa24.57■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 KCNQ4P56696 695 aa24.57■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 AKT1S1Q96B36 256 aa24.57■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 KLHL34Q8N239 644 aa24.56■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.56■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 SLC16A10Q8TF71 515 aa24.55■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 UTRNP46939 3433 aa24.55■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 POLD1P28340 1107 aa24.54■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
PSME3-216ENST00000593111 GPR162Q16538 588 aa24.53■■□□□ 1.52
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