RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.8■□□□□ 0.6
NEDD4L-232ENST00000591579 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.79■□□□□ 0.6
NEDD4L-232ENST00000591579 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
NEDD4L-232ENST00000591579 AXIN2Q9Y2T1 843 aa18.79■□□□□ 0.6
NEDD4L-232ENST00000591579 PLSCR1O15162 318 aa18.77■□□□□ 0.6
NEDD4L-232ENST00000591579 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
NEDD4L-232ENST00000591579 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.76■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.76■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.75■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 ARHGEF25Q86VW2 580 aa18.75■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.75■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 ZBTB7AO95365 584 aa18.74■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa18.74■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 COL18A1P39060 1754 aa18.73■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 WNK3Q9BYP7 1800 aa18.73■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 CARD10Q9BWT7 1032 aa18.73■□□□□ 0.59
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NEDD4L-232ENST00000591579 STK32BQ9NY57 414 aa18.72■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 BCL9O00512 1426 aa18.72■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.72■□□□□ 0.59
NEDD4L-232ENST00000591579 CASZ1Q86V15 1759 aa18.7■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 NFAT5O94916 1531 aa18.7■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 EXOC5O00471 708 aa18.7■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 TXNRD1Q16881 649 aa18.7■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 TNS2Q63HR2 1409 aa18.7■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 SBF2Q86WG5 1849 aa18.7■□□□□ 0.58
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NEDD4L-232ENST00000591579 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 AKAP12Q02952 1782 aa18.68■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 MYOM1P52179 1685 aa18.67■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 NEUROD1Q13562 356 aa18.67■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.67■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 18.5
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NEDD4L-232ENST00000591579 PTGER2P43116 358 aa18.66■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCC6O95255 1503 aa18.65■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC15A2Q16348 729 aa18.65■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 ACSBG1Q96GR2 724 aa18.65■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 NLRP2Q9NX02 1062 aa18.65■□□□□ 0.58
NEDD4L-232ENST00000591579 NME9Q86XW9 330 aa18.63■□□□□ 0.57
NEDD4L-232ENST00000591579 ERBB3P21860 1342 aa18.63■□□□□ 0.57
NEDD4L-232ENST00000591579 RGPD5Q99666 1765 aa18.63■□□□□ 0.57
NEDD4L-232ENST00000591579 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
NEDD4L-232ENST00000591579 MTFR1LQ9H019 292 aa18.62■□□□□ 0.57
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NEDD4L-232ENST00000591579 USP31Q70CQ4 1352 aa18.6■□□□□ 0.57
NEDD4L-232ENST00000591579 IL2RBP14784 551 aa18.6■□□□□ 0.57
NEDD4L-232ENST00000591579 MON2Q7Z3U7 1717 aa18.6■□□□□ 0.57
NEDD4L-232ENST00000591579 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa18.59■□□□□ 0.57
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NEDD4L-232ENST00000591579 SYT17Q9BSW7 474 aa18.59■□□□□ 0.57
NEDD4L-232ENST00000591579 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.58■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 ARXQ96QS3 562 aa18.56■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.56■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.56■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF827Q17R98 1081 aa18.55■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 PAPPAQ13219 1627 aa18.55■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.54■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 USP54Q70EL1 1684 aa18.54■□□□□ 0.56
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NEDD4L-232ENST00000591579 A0A1W2PP64 1363 aa18.53■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 KLHL34Q8N239 644 aa18.52■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
NEDD4L-232ENST00000591579 LRRC4BQ9NT99 713 aa18.52■□□□□ 0.56
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NEDD4L-232ENST00000591579 LTN1O94822 1766 aa18.52■□□□□ 0.55
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NEDD4L-232ENST00000591579 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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NEDD4L-232ENST00000591579 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD4L-232ENST00000591579 IP6K1Q92551 441 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD4L-232ENST00000591579 AKT1S1Q96B36 256 aa18.47■□□□□ 0.55
NEDD4L-232ENST00000591579 KCNQ4P56696 695 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD4L-232ENST00000591579 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NEDD4L-232ENST00000591579 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.46■□□□□ 0.55
NEDD4L-232ENST00000591579 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa18.45■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 TONSLQ96HA7 1378 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.44■□□□□ 0.54
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NEDD4L-232ENST00000591579 COG3Q96JB2 828 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.44■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 AMPHP49418 695 aa18.43■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 HOXC9P31274 260 aa18.42■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.42■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 MEGF6O75095 1541 aa18.41■□□□□ 0.54
NEDD4L-232ENST00000591579 NSD2O96028 1365 aa18.41■□□□□ 0.54
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