RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ARHGEF25Q86VW2 580 aa36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX12O15370 315 aa36.76■■■■□ 3.48
CAPNS1-211ENST00000590874 AKAP12Q02952 1782 aa36.76■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNH5Q8NCM2 988 aa36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 WNK3Q9BYP7 1800 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC21AQ8NDW8 1320 aa36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PTF1AQ7RTS3 328 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 NFAT5O94916 1531 aa36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PLSCR1O15162 318 aa36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SBF2Q86WG5 1849 aa36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-211ENST00000590874 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-211ENST00000590874 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa36.67■■■■□ 3.46
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL9O00512 1426 aa36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-211ENST00000590874 RGPD5Q99666 1765 aa36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-211ENST00000590874 SPON1Q9HCB6 807 aa36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-211ENST00000590874 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNQ2O43526 872 aa36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 MON2Q7Z3U7 1717 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.61■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC6O95255 1503 aa36.6■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PROM2Q8N271 834 aa36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CD163L1Q9NR16 1453 aa36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC7Q96M83 1385 aa36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 USP31Q70CQ4 1352 aa36.57■■■■□ 3.45
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC5O00471 708 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-211ENST00000590874 TNS2Q63HR2 1409 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NME9Q86XW9 330 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CASZ1Q86V15 1759 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-211ENST00000590874 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-211ENST00000590874 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-211ENST00000590874 USP54Q70EL1 1684 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-211ENST00000590874 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.51■■■■□ 3.43
CAPNS1-211ENST00000590874 ERBB3P21860 1342 aa36.5■■■■□ 3.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNRD1Q16881 649 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-211ENST00000590874 TMC1Q8TDI8 760 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-211ENST00000590874 NLRP2Q9NX02 1062 aa36.45■■■■□ 3.43
CAPNS1-211ENST00000590874 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB7AO95365 584 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 YY1P25490 414 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 NHSQ6T4R5 1651 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 LTN1O94822 1766 aa36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ACSBG1Q96GR2 724 aa36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 STK32BQ9NY57 414 aa36.41■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PP64 1363 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD24Q8TF21 1146 aa36.4■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 IL2RBP14784 551 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC15A2Q16348 729 aa36.39■■■■□ 3.42
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGER2P43116 358 aa36.37■■■■□ 3.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TONSLQ96HA7 1378 aa36.36■■■■□ 3.41
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOM1P52179 1685 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-211ENST00000590874 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-211ENST00000590874 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF8L1A6NGE4 600 aa36.32■■■■□ 3.4
CAPNS1-211ENST00000590874 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
CAPNS1-211ENST00000590874 PAPPAQ13219 1627 aa36.29■■■■□ 3.4
CAPNS1-211ENST00000590874 TESK2Q96S53 571 aa36.27■■■■□ 3.4
CAPNS1-211ENST00000590874 IP6K1Q92551 441 aa36.26■■■■□ 3.4
CAPNS1-211ENST00000590874 BTAF1O14981 1849 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MTFR1LQ9H019 292 aa36.25■■■■□ 3.39
CAPNS1-211ENST00000590874 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SGIP1Q9BQI5 828 aa36.23■■■■□ 3.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF827Q17R98 1081 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC4BQ9NT99 713 aa36.2■■■■□ 3.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K19Q56UN5 1328 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT17Q9BSW7 474 aa36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
CAPNS1-211ENST00000590874 FBLN1P23142 703 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-211ENST00000590874 COG3Q96JB2 828 aa36.17■■■■□ 3.38
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXC9P31274 260 aa36.15■■■■□ 3.38
CAPNS1-211ENST00000590874 AMPHP49418 695 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-211ENST00000590874 AKT1S1Q96B36 256 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ARXQ96QS3 562 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.1■■■■□ 3.37
CAPNS1-211ENST00000590874 MEGF6O75095 1541 aa36.08■■■■□ 3.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC27A3Q5K4L6 730 aa36.07■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 NSD2O96028 1365 aa36.05■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC24A1O60721 1099 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNQ4P56696 695 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 DOT1LQ8TEK3 1739 aa36.04■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RTL1A6NKG5 1358 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K5Q99683 1374 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SHANK3Q9BYB0 1731 aa36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RGPD2P0DJD1 1756 aa36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms