RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 FCHSD2O94868 740 aa34.43■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 NGEFQ8N5V2 710 aa34.42■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 RSPH6AQ9H0K4 717 aa34.42■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.42■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 TCP11L2Q8N4U5 519 aa34.41■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 PDE3BQ13370 1112 aa34.39■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.39■■■■□ 3.1
SCAMP4-210ENST00000588555 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
SCAMP4-210ENST00000588555 IP6K1Q92551 441 aa34.37■■■■□ 3.09
SCAMP4-210ENST00000588555 HMOX1P09601 288 aa34.36■■■■□ 3.09
SCAMP4-210ENST00000588555 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHG5O94827 1062 aa34.34■■■■□ 3.09
SCAMP4-210ENST00000588555 PRKAR2BP31323 418 aa34.34■■■■□ 3.09
SCAMP4-210ENST00000588555 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
SCAMP4-210ENST00000588555 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
SCAMP4-210ENST00000588555 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa34.33■■■■□ 3.09
SCAMP4-210ENST00000588555 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 CDCA7LQ96GN5 454 aa34.31■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.3■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 IGSF1Q8N6C5 1336 aa34.3■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC27Q2M243 656 aa34.29■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.29■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.28■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 KDRP35968 1356 aa34.28■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 TMPOP42166 694 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 WWC1Q8IX03 1113 aa34.28■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 EYA1Q99502 592 aa34.28■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 NEUROD2Q15784 382 aa34.27■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCA3Q99758 1704 aa34.27■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 PHACTR3Q96KR7 559 aa34.26■■■■□ 3.08
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB7CA1YPR0 619 aa34.26■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA2Q08379 1002 aa34.25■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 COL18A1P39060 1754 aa34.24■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 CPDO75976 1380 aa34.24■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCC6O95255 1503 aa34.23■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 TOM1O60784 492 aa34.21■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.21■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 NEFMP07197 916 aa34.21■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 RGPD5Q99666 1765 aa34.2■■■■□ 3.07
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM35Q9UPQ4 493 aa34.19■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 SLFN5Q08AF3 891 aa34.18■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 NFE2L2Q16236 605 aa34.18■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0232Q92628 1395 aa34.18■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 RIPK4P57078 832 aa34.17■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.17■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 DUSP27Q5VZP5 1158 aa34.16■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR63Q8IWG1 891 aa34.16■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.15■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.14■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 NCAPD2Q15021 1401 aa34.14■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 PHLPP1O60346 1717 aa34.14■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 DLG5Q8TDM6 1919 aa34.14■■■■□ 3.06
SCAMP4-210ENST00000588555 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.13■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 NBPF4Q96M43 638 aa34.13■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 E9PSI1 815 aa34.13■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.13■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 ERBB3P21860 1342 aa34.12■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.11■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.1■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 CHRNA2Q15822 529 aa34.1■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 PIP4K2BP78356 416 aa34.09■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.08■■■■□ 3.05
SCAMP4-210ENST00000588555 CERKQ8TCT0 537 aa34.06■■■■□ 3.04
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
SCAMP4-210ENST00000588555 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
SCAMP4-210ENST00000588555 PRDM11Q9NQV5 511 aa34.04■■■■□ 3.04
SCAMP4-210ENST00000588555 IL16Q14005 1332 aa34.03■■■■□ 3.04
SCAMP4-210ENST00000588555 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.04
SCAMP4-210ENST00000588555 LMOD3Q0VAK6 560 aa34■■■■□ 3.03
SCAMP4-210ENST00000588555 RCAN3Q9UKA8 241 aa33.98■■■■□ 3.03
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF123Q5XPI4 1314 aa33.97■■■■□ 3.03
SCAMP4-210ENST00000588555 GAS2L2Q8NHY3 880 aa33.96■■■■□ 3.03
SCAMP4-210ENST00000588555 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
SCAMP4-210ENST00000588555 MYH16Q9H6N6 1097 aa33.95■■■■□ 3.03
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM83GA6ND36 823 aa33.95■■■■□ 3.02
SCAMP4-210ENST00000588555 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.02
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.93■■■■□ 3.02
SCAMP4-210ENST00000588555 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
SCAMP4-210ENST00000588555 FANCIQ9NVI1 1328 aa33.91■■■■□ 3.02
SCAMP4-210ENST00000588555 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa33.9■■■■□ 3.02
SCAMP4-210ENST00000588555 DCTN1Q14203 1278 aa33.9■■■■□ 3.02
SCAMP4-210ENST00000588555 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR17Q8IZU2 1322 aa33.9■■■■□ 3.02
SCAMP4-210ENST00000588555 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF853P0CG23 659 aa33.87■■■■□ 3.01
SCAMP4-210ENST00000588555 NEFLP07196 543 aa33.86■■■■□ 3.01
SCAMP4-210ENST00000588555 MCM10Q7L590 875 aa33.86■■■■□ 3.01
SCAMP4-210ENST00000588555 IFT57Q9NWB7 429 aa33.86■■■■□ 3.01
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP3K5Q99683 1374 aa33.86■■■■□ 3.01
SCAMP4-210ENST00000588555 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC37A3O60309 1634 aa33.85■■■■□ 3.01
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.84■■■■□ 3.01
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