RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, human

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GIPC1-205	ENST00000586027	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		42.78	■■■■■ 4.44
GIPC1-205	ENST00000586027	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
GIPC1-205	ENST00000586027	ABCC6	O95255	1503 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GIPC1-205	ENST00000586027	PEAK1	Q9H792	1746 aa		42.75	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	POLK	Q9UBT6	870 aa		42.75	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	42.74	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.74	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	IP6K1	Q92551	441 aa		42.74	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	HOXC9	P31274	260 aa		42.73	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	AMPH	P49418	695 aa		42.73	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	RGPD5	Q99666	1765 aa		42.73	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	ATRN	O75882	1429 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	STRN4	Q9NRL3	753 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	42.71	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	RTL1	A6NKG5	1358 aa		42.7	■■■■■ 4.43
GIPC1-205	ENST00000586027	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	42.67	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	42.66	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	42.66	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	FLT4	P35916	1363 aa		42.66	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	EVA1C	P58658	441 aa		42.65	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	VPS72	Q15906	364 aa		42.65	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		42.65	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		42.65	■■■■■ 4.42
GIPC1-205	ENST00000586027	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		42.62	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	ERBB3	P21860	1342 aa		42.62	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		42.61	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		42.6	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	INSR	P06213	1382 aa		42.59	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		42.57	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		42.57	■■■■■ 4.41
GIPC1-205	ENST00000586027	GLI3	P10071	1580 aa		42.56	■■■■■ 4.4
GIPC1-205	ENST00000586027	MTHFS	P49914	203 aa		42.56	■■■■■ 4.4
GIPC1-205	ENST00000586027	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		42.55	■■■■■ 4.4
GIPC1-205	ENST00000586027	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
GIPC1-205	ENST00000586027	CRB1	P82279	1406 aa		42.54	■■■■■ 4.4
GIPC1-205	ENST00000586027	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		42.54	■■■■■ 4.4
GIPC1-205	ENST00000586027	PPP2R1A	P30153	589 aa		42.53	■■■■■ 4.4
GIPC1-205	ENST00000586027	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
GIPC1-205	ENST00000586027	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		42.52	■■■■■ 4.4
GIPC1-205	ENST00000586027	RXRB	P28702	533 aa		42.5	■■■■■ 4.39
GIPC1-205	ENST00000586027	USP35	Q9P2H5	1018 aa		42.5	■■■■■ 4.39
GIPC1-205	ENST00000586027	RALBP1	Q15311	655 aa		42.48	■■■■■ 4.39
GIPC1-205	ENST00000586027	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GIPC1-205	ENST00000586027	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	42.45	■■■■■ 4.39
GIPC1-205	ENST00000586027	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		42.45	■■■■■ 4.39
GIPC1-205	ENST00000586027	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
GIPC1-205	ENST00000586027	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		42.42	■■■■■ 4.38
GIPC1-205	ENST00000586027	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GIPC1-205	ENST00000586027	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GIPC1-205	ENST00000586027	NBPF4	Q96M43	638 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GIPC1-205	ENST00000586027	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	42.41	■■■■■ 4.38
GIPC1-205	ENST00000586027	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
GIPC1-205	ENST00000586027	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
GIPC1-205	ENST00000586027	RGS12	O14924	1447 aa		42.36	■■■■■ 4.37
GIPC1-205	ENST00000586027	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		42.36	■■■■■ 4.37
GIPC1-205	ENST00000586027	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
GIPC1-205	ENST00000586027	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	42.35	■■■■■ 4.37
GIPC1-205	ENST00000586027	IL13	P35225	146 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GIPC1-205	ENST00000586027	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GIPC1-205	ENST00000586027	EYA1	Q99502	592 aa		42.34	■■■■■ 4.37
GIPC1-205	ENST00000586027	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
GIPC1-205	ENST00000586027	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		42.31	■■■■■ 4.36
GIPC1-205	ENST00000586027	DISP2	A7MBM2	1401 aa		42.3	■■■■■ 4.36
GIPC1-205	ENST00000586027	NCAPD2	Q15021	1401 aa		42.29	■■■■■ 4.36
GIPC1-205	ENST00000586027	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GIPC1-205	ENST00000586027	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
GIPC1-205	ENST00000586027	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GIPC1-205	ENST00000586027	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GIPC1-205	ENST00000586027	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		42.26	■■■■■ 4.36
GIPC1-205	ENST00000586027	ANP32C	O43423	234 aa		42.26	■■■■■ 4.35
GIPC1-205	ENST00000586027	CFAP53	Q96M91	514 aa		42.26	■■■■■ 4.35
GIPC1-205	ENST00000586027		A0A0G2JS52	829 aa		42.25	■■■■■ 4.35
GIPC1-205	ENST00000586027	MYT1	Q01538	1121 aa		42.25	■■■■■ 4.35
GIPC1-205	ENST00000586027	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		42.24	■■■■■ 4.35
GIPC1-205	ENST00000586027	MEGF6	O75095	1541 aa		42.21	■■■■■ 4.35
GIPC1-205	ENST00000586027	IL2RB	P14784	551 aa		42.2	■■■■■ 4.35
GIPC1-205	ENST00000586027	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		42.18	■■■■■ 4.34
GIPC1-205	ENST00000586027	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
GIPC1-205	ENST00000586027	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
GIPC1-205	ENST00000586027	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		42.16	■■■■■ 4.34
GIPC1-205	ENST00000586027	LRRC37A3	O60309	1634 aa		42.15	■■■■■ 4.34
GIPC1-205	ENST00000586027	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		42.13	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		42.12	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	KDR	P35968	1356 aa		42.11	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		42.11	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	DDB1	Q16531	1140 aa		42.1	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	HMOX1	P09601	288 aa		42.09	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	CCDC184	Q52MB2	194 aa		42.08	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	TNS2	Q63HR2	1409 aa		42.07	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	42.07	■■■■■ 4.33
GIPC1-205	ENST00000586027	NUDC	Q9Y266	331 aa		42.07	■■■■■ 4.33

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