RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584374.1

ITGB4-211, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB4, Length 950 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-211ENST00000584374 ABCC6O95255 1503 aa23.6■■□□□ 1.37
ITGB4-211ENST00000584374 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.6■■□□□ 1.37
ITGB4-211ENST00000584374 CDCA8Q53HL2 280 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGB4-211ENST00000584374 BARGINQ6ZT62 677 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGB4-211ENST00000584374 CRB1P82279 1406 aa23.59■■□□□ 1.37
ITGB4-211ENST00000584374 USP35Q9P2H5 1018 aa23.57■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 A0A0G2JS52 829 aa23.56■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 MYT1Q01538 1121 aa23.56■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.56■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 RGPD5Q99666 1765 aa23.55■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.55■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 LTN1O94822 1766 aa23.53■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.53■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 FAM182BQ5T319 152 aa23.52■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 CCDC125Q86Z20 511 aa23.52■■□□□ 1.36
ITGB4-211ENST00000584374 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 FYB1O15117 783 aa23.51■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.5■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.49■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 COG3Q96JB2 828 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 ERBB3P21860 1342 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 DISP2A7MBM2 1401 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 LRRC37A3O60309 1634 aa23.48■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 FBLN1P23142 703 aa23.47■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.47■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.46■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.46■■□□□ 1.35
ITGB4-211ENST00000584374 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.45■■□□□ 1.34
ITGB4-211ENST00000584374 DEFB132Q7Z7B7 95 aa23.43■■□□□ 1.34
ITGB4-211ENST00000584374 IP6K1Q92551 441 aa23.43■■□□□ 1.34
ITGB4-211ENST00000584374 PEAK1Q9H792 1746 aa23.42■■□□□ 1.34
ITGB4-211ENST00000584374 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ITGB4-211ENST00000584374 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.42■■□□□ 1.34
ITGB4-211ENST00000584374 CCDC7Q96M83 1385 aa23.41■■□□□ 1.34
ITGB4-211ENST00000584374 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.41■■□□□ 1.34
ITGB4-211ENST00000584374 RGPD1P0DJD0 1748 aa23.41■■□□□ 1.34
ITGB4-211ENST00000584374 HOXC9P31274 260 aa23.39■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 PDE3BQ13370 1112 aa23.39■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.39■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.38■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 RTL1A6NKG5 1358 aa23.38■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 DDB1Q16531 1140 aa23.36■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.35■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 NLRP2Q9NX02 1062 aa23.35■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.34■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 TNS2Q63HR2 1409 aa23.34■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 TRIM37O94972 964 aa23.34■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.33■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 AMPHP49418 695 aa23.33■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 PANK3Q9H999 370 aa23.33■■□□□ 1.33
ITGB4-211ENST00000584374 BCL9O00512 1426 aa23.33■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.31■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.31■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 BAG6P46379 1132 aa23.31■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 INSRP06213 1382 aa23.29■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 FLT4P35916 1363 aa23.29■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 IL2RBP14784 551 aa23.29■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.29■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.28■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.28■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 SBF2Q86WG5 1849 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.27■■□□□ 1.32
ITGB4-211ENST00000584374 EXOC5O00471 708 aa23.26■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.26■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.25■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 NBPF4Q96M43 638 aa23.25■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 MEGF6O75095 1541 aa23.24■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 APBA3O96018 575 aa23.24■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 NSD2O96028 1365 aa23.24■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 POLKQ9UBT6 870 aa23.23■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 RREB1Q92766 1687 aa23.22■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.21■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 NCAPD2Q15021 1401 aa23.21■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ITGB4-211ENST00000584374 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.2■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.2■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.18■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.18■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 NHSQ6T4R5 1651 aa23.18■■□□□ 1.3
ITGB4-211ENST00000584374 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms