RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	EVA1C	P58658	441 aa		34.05	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	34.05	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	34.04	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	34.04	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	MORC1	Q86VD1	984 aa		34.04	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	ATRN	O75882	1429 aa		34.04	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	34.03	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	34.03	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	34.02	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	AMPH	P49418	695 aa		34.02	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	34.02	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		34.02	■■■■□ 3.04
GPS1-223	ENST00000584229	PEAK1	Q9H792	1746 aa		34	■■■■□ 3.03
GPS1-223	ENST00000584229	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.97	■■■■□ 3.03
GPS1-223	ENST00000584229	RXRB	P28702	533 aa		33.97	■■■■□ 3.03
GPS1-223	ENST00000584229	VPS72	Q15906	364 aa		33.97	■■■■□ 3.03
GPS1-223	ENST00000584229	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		33.97	■■■■□ 3.03
GPS1-223	ENST00000584229	GLI3	P10071	1580 aa		33.97	■■■■□ 3.03
GPS1-223	ENST00000584229	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		33.96	■■■■□ 3.03
GPS1-223	ENST00000584229	RTL1	A6NKG5	1358 aa		33.95	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.94	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	33.94	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	33.93	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	33.93	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	USP35	Q9P2H5	1018 aa		33.93	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		33.93	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	HOXC9	P31274	260 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	IP6K1	Q92551	441 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	33.92	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		33.92	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.91	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	FLT4	P35916	1363 aa		33.9	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		33.9	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	CRB1	P82279	1406 aa		33.89	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		33.89	■■■■□ 3.02
GPS1-223	ENST00000584229	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0G2JS52	829 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	MYT1	Q01538	1121 aa		33.88	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		33.87	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		33.87	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	33.87	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	ERBB3	P21860	1342 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		33.85	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		33.84	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	RGS12	O14924	1447 aa		33.83	■■■■□ 3.01
GPS1-223	ENST00000584229	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		33.82	■■■■□ 3
GPS1-223	ENST00000584229	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
GPS1-223	ENST00000584229	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		33.82	■■■■□ 3
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		33.82	■■■■□ 3
GPS1-223	ENST00000584229	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.81	■■■■□ 3
GPS1-223	ENST00000584229	INSR	P06213	1382 aa		33.81	■■■■□ 3
GPS1-223	ENST00000584229	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
GPS1-223	ENST00000584229	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		33.78	■■■■□ 3
GPS1-223	ENST00000584229	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		33.77	■■■■□ 3
GPS1-223	ENST00000584229	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		33.74	■■■□□ 2.99
GPS1-223	ENST00000584229	MTHFS	P49914	203 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-223	ENST00000584229	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-223	ENST00000584229	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-223	ENST00000584229	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC37A3	O60309	1634 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-223	ENST00000584229	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-223	ENST00000584229	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-223	ENST00000584229	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		33.68	■■■□□ 2.98
GPS1-223	ENST00000584229	PPP2R1A	P30153	589 aa		33.66	■■■□□ 2.98
GPS1-223	ENST00000584229	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.66	■■■□□ 2.98
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		33.64	■■■□□ 2.98
GPS1-223	ENST00000584229	NBPF4	Q96M43	638 aa		33.64	■■■□□ 2.98
GPS1-223	ENST00000584229	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
GPS1-223	ENST00000584229	RALBP1	Q15311	655 aa		33.61	■■■□□ 2.97
GPS1-223	ENST00000584229	IL2RB	P14784	551 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GPS1-223	ENST00000584229	CFAP53	Q96M91	514 aa		33.6	■■■□□ 2.97
GPS1-223	ENST00000584229	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
GPS1-223	ENST00000584229	DISP2	A7MBM2	1401 aa		33.59	■■■□□ 2.97
GPS1-223	ENST00000584229	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		33.58	■■■□□ 2.97
GPS1-223	ENST00000584229	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		33.57	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	EYA1	Q99502	592 aa		33.57	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	PDE3B	Q13370	1112 aa		33.56	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	DDB1	Q16531	1140 aa		33.56	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	33.56	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	MEGF6	O75095	1541 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	TNS2	Q63HR2	1409 aa		33.53	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	IL13	P35225	146 aa		33.52	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
GPS1-223	ENST00000584229	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.51	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	EXOC5	O00471	708 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	FAM182B	Q5T319	152 aa		33.5	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.48	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	ANP32C	O43423	234 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.47	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		33.46	■■■□□ 2.95
GPS1-223	ENST00000584229	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.45	■■■□□ 2.95

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