RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40■■■■□ 3.99
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PARD3Q8TEW0 1356 aa39.98■■■■□ 3.99
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NFAT5O94916 1531 aa39.98■■■■□ 3.99
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRRC37A3O60309 1634 aa39.97■■■■□ 3.99
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CD163L1Q9NR16 1453 aa39.96■■■■□ 3.99
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa39.96■■■■□ 3.99
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DDB1Q16531 1140 aa39.95■■■■□ 3.99
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa39.94■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OVOS2Q6IE36 1432 aa39.94■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WNK3Q9BYP7 1800 aa39.94■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa39.93■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NME9Q86XW9 330 aa39.91■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP31Q70CQ4 1352 aa39.91■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RREB1Q92766 1687 aa39.9■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PEAK1Q9H792 1746 aa39.9■■■■□ 3.98
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CARD10Q9BWT7 1032 aa39.88■■■■□ 3.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP54Q70EL1 1684 aa39.88■■■■□ 3.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABCC6O95255 1503 aa39.87■■■■□ 3.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TERF2IPQ9NYB0 399 aa39.86■■■■□ 3.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NUP188Q5SRE5 1749 aa39.85■■■■□ 3.97
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A0A1W2PP64 1363 aa39.84■■■■□ 3.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SBF2Q86WG5 1849 aa39.83■■■■□ 3.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa39.82■■■■□ 3.97
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LTN1O94822 1766 aa39.8■■■■□ 3.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NBPF14Q5TI25 921 aa39.8■■■■□ 3.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TESK2Q96S53 571 aa39.8■■■■□ 3.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC7Q96M83 1385 aa39.8■■■■□ 3.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ERBB3P21860 1342 aa39.74■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EXOC5O00471 708 aa39.74■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NINLQ9Y2I6 1382 aa39.73■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SLC24A1O60721 1099 aa39.72■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NLRP2Q9NX02 1062 aa39.72■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa39.72■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PTF1AQ7RTS3 328 aa39.71■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BCL9O00512 1426 aa39.7■■■■□ 3.95
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PLSCR1O15162 318 aa39.69■■■■□ 3.94
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TNS2Q63HR2 1409 aa39.68■■■■□ 3.94
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKRD24Q8TF21 1146 aa39.67■■■■□ 3.94
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP47Q96K76 1375 aa39.62■■■■□ 3.93
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMF1P82094 1093 aa39.59■■■■□ 3.93
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa39.58■■■■□ 3.93
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KCNQ2O43526 872 aa39.52■■■■□ 3.92
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NHSQ6T4R5 1651 aa39.51■■■■□ 3.92
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MAP3K19Q56UN5 1328 aa39.51■■■■□ 3.92
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TXNRD1Q16881 649 aa39.49■■■■□ 3.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FBLN1P23142 703 aa39.48■■■■□ 3.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AMPHP49418 695 aa39.48■■■■□ 3.91
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HOXC9P31274 260 aa39.46■■■■□ 3.91
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDCA8Q53HL2 280 aa39.44■■■■□ 3.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP39.44■■■■□ 3.9
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FYB1O15117 783 aa39.41■■■■□ 3.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 STK32BQ9NY57 414 aa39.4■■■■□ 3.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CASZ1Q86V15 1759 aa39.4■■■■□ 3.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.39■■■■□ 3.9
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BTAF1O14981 1849 aa39.37■■■■□ 3.89
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RTL1A6NKG5 1358 aa39.37■■■■□ 3.89
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RGPD2P0DJD1 1756 aa39.36■■■■□ 3.89
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLSPNQ9HAW4 1339 aa39.32■■■■□ 3.88
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZBTB7AO95365 584 aa39.31■■■■□ 3.88
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MYOM1P52179 1685 aa39.29■■■■□ 3.88
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MEGF6O75095 1541 aa39.26■■■■□ 3.88
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NBPF6Q5VWK0 638 aa39.24■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NBPF4Q96M43 638 aa39.24■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CARD14Q9BXL6 1004 aa39.24■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NSD3Q9BZ95 1437 aa39.23■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PAPPAQ13219 1627 aa39.23■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USHBP1Q8N6Y0 703 aa39.23■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
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