RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 EVC2Q86UK5 1308 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS2-208ENST00000576635 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.26■■□□□ 1.15
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SPNS2-208ENST00000576635 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS2-208ENST00000576635 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS2-208ENST00000576635 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-208ENST00000576635 NFAT5O94916 1531 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-208ENST00000576635 SPON1Q9HCB6 807 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS2-208ENST00000576635 PLSCR1O15162 318 aa22.22■■□□□ 1.15
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SPNS2-208ENST00000576635 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.22■■□□□ 1.15
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SPNS2-208ENST00000576635 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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SPNS2-208ENST00000576635 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-208ENST00000576635 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-208ENST00000576635 LTN1O94822 1766 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS2-208ENST00000576635 USP54Q70EL1 1684 aa22.17■■□□□ 1.14
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SPNS2-208ENST00000576635 TNS2Q63HR2 1409 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS2-208ENST00000576635 NEUROD1Q13562 356 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS2-208ENST00000576635 CCDC7Q96M83 1385 aa22.12■■□□□ 1.13
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SPNS2-208ENST00000576635 TXNRD1Q16881 649 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS2-208ENST00000576635 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-208ENST00000576635 ZBTB7AO95365 584 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS2-208ENST00000576635 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
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SPNS2-208ENST00000576635 USP31Q70CQ4 1352 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS2-208ENST00000576635 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS2-208ENST00000576635 BTAF1O14981 1849 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS2-208ENST00000576635 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS2-208ENST00000576635 ERBB3P21860 1342 aa22.06■■□□□ 1.12
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SPNS2-208ENST00000576635 NME9Q86XW9 330 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS2-208ENST00000576635 STK32BQ9NY57 414 aa22.06■■□□□ 1.12
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SPNS2-208ENST00000576635 SLC15A2Q16348 729 aa22.04■■□□□ 1.12
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SPNS2-208ENST00000576635 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.99■■□□□ 1.11
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SPNS2-208ENST00000576635 MTFR1LQ9H019 292 aa21.98■■□□□ 1.11
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SPNS2-208ENST00000576635 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS2-208ENST00000576635 CHD4Q14839 1912 aa21.96■■□□□ 1.11
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SPNS2-208ENST00000576635 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF827Q17R98 1081 aa21.93■■□□□ 1.1
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SPNS2-208ENST00000576635 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.92■■□□□ 1.1
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SPNS2-208ENST00000576635 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.84■■□□□ 1.09
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SPNS2-208ENST00000576635 TESK2Q96S53 571 aa21.84■■□□□ 1.09
SPNS2-208ENST00000576635 HOXC9P31274 260 aa21.83■■□□□ 1.09
SPNS2-208ENST00000576635 MEGF6O75095 1541 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 KCNQ4P56696 695 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS2-208ENST00000576635 COG3Q96JB2 828 aa21.82■■□□□ 1.08
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