RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574157.5

NOMO3-211, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 3

Gene NOMO3, Length 821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-211ENST00000574157 FOXO3O43524 673 aa12.08□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 PSME1Q06323 249 aa12.08□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 RTL1A6NKG5 1358 aa12.07□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 ARHGEF10O15013 1369 aa12.07□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.07□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 PEAK1Q9H792 1746 aa12.07□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.07□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.06□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 ABCA3Q99758 1704 aa12.06□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 MTHFSP49914 203 aa12.05□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 CFAP53Q96M91 514 aa12.05□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 POLKQ9UBT6 870 aa12.05□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 NLRP6P59044 892 aa12.04□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 ABTB2Q8N961 1025 aa12.04□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 FLT4P35916 1363 aa12.04□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.03□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 LTN1O94822 1766 aa12.02□□□□□ -0.48
NOMO3-211ENST00000574157 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 POTEHQ6S545 545 aa12.02□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.02□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 SLC4A2P04920 1241 aa12.01□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.01□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.01□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 PLEKHG5O94827 1062 aa12□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 FAM9BQ8IZU0 186 aa12□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 CPDO75976 1380 aa12□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa12□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.99□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 NCAPD2Q15021 1401 aa11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 NUDCQ9Y266 331 aa11.98□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 COL18A1P39060 1754 aa11.97□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.97□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.97□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 GCP02774 474 aa11.97□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.97□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.97□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 A0A0G2JS52 829 aa11.96□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 FBLN1P23142 703 aa11.96□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 IL13P35225 146 aa11.96□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 MYT1Q01538 1121 aa11.96□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.96□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
NOMO3-211ENST00000574157 ATRNO75882 1429 aa11.95□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 KDRP35968 1356 aa11.95□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 HOXC9P31274 260 aa11.95□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 CCDC125Q86Z20 511 aa11.95□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 NGEFQ8N5V2 710 aa11.95□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 IP6K1Q92551 441 aa11.95□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.93□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 IGSF1Q8N6C5 1336 aa11.93□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 AMPHP49418 695 aa11.93□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.93□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 ZBTB22O15209 634 aa11.92□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 FCHSD2O94868 740 aa11.92□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa11.92□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 SOX12O15370 315 aa11.91□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 ABCB7O75027 752 aa11.91□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 RUNDC1Q96C34 613 aa11.91□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.91□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 KIAA0232Q92628 1395 aa11.91□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 DEFB132Q7Z7B7 95 aa11.9□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.9□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.9□□□□□ -0.5
NOMO3-211ENST00000574157 EP400Q96L91 3159 aa11.89□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.89□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 ERBB3P21860 1342 aa11.89□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 ZNF521Q96K83 1311 aa11.89□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 FOXD4L1Q9NU39 408 aa11.89□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 RGPD5Q99666 1765 aa11.87□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 CCDC27Q2M243 656 aa11.87□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.87□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.87□□□□□ -0.51
NOMO3-211ENST00000574157 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms