RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 PIK3C2AO00443 1686 aa30.24■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 PLSCR1O15162 318 aa30.24■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.23■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 RREB1Q92766 1687 aa30.22■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 EXOC5O00471 708 aa30.2■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 SPON1Q9HCB6 807 aa30.2■■■□□ 2.43
SLC12A4-208ENST00000572010 COL18A1P39060 1754 aa30.19■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.19■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 NUP188Q5SRE5 1749 aa30.18■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 KCNQ2O43526 872 aa30.17■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 TMC1Q8TDI8 760 aa30.17■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 LRRC37A3O60309 1634 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 AKAP12Q02952 1782 aa30.15■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 PEAK1Q9H792 1746 aa30.14■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
SLC12A4-208ENST00000572010 PTF1AQ7RTS3 328 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC7Q96M83 1385 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa30.13■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 BCL9O00512 1426 aa30.11■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 DCAF8L1A6NGE4 600 aa30.1■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 NME9Q86XW9 330 aa30.1■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 USP31Q70CQ4 1352 aa30.09■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.09■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 NFAT5O94916 1531 aa30.08■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 PROM2Q8N271 834 aa30.08■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa30.08■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.08■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 SBF2Q86WG5 1849 aa30.08■■■□□ 2.41
SLC12A4-208ENST00000572010 RGPD5Q99666 1765 aa30.07■■■□□ 2.4
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SLC12A4-208ENST00000572010 TXNRD1Q16881 649 aa30.05■■■□□ 2.4
SLC12A4-208ENST00000572010 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
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SLC12A4-208ENST00000572010 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.04■■■□□ 2.4
SLC12A4-208ENST00000572010 STK32BQ9NY57 414 aa30.03■■■□□ 2.4
SLC12A4-208ENST00000572010 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.03■■■□□ 2.4
SLC12A4-208ENST00000572010 ERBB3P21860 1342 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC12A4-208ENST00000572010 IL2RBP14784 551 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC12A4-208ENST00000572010 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
SLC12A4-208ENST00000572010 MON2Q7Z3U7 1717 aa30.02■■■□□ 2.4
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30■■■□□ 2.39
SLC12A4-208ENST00000572010 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC12A4-208ENST00000572010 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.99■■■□□ 2.39
SLC12A4-208ENST00000572010 TNS2Q63HR2 1409 aa29.98■■■□□ 2.39
SLC12A4-208ENST00000572010 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
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SLC12A4-208ENST00000572010 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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SLC12A4-208ENST00000572010 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SLC12A4-208ENST00000572010 A0A1W2PP64 1363 aa29.93■■■□□ 2.38
SLC12A4-208ENST00000572010 IP6K1Q92551 441 aa29.92■■■□□ 2.38
SLC12A4-208ENST00000572010 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.9■■■□□ 2.38
SLC12A4-208ENST00000572010 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
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SLC12A4-208ENST00000572010 USP54Q70EL1 1684 aa29.9■■■□□ 2.38
SLC12A4-208ENST00000572010 LTN1O94822 1766 aa29.88■■■□□ 2.37
SLC12A4-208ENST00000572010 CASZ1Q86V15 1759 aa29.87■■■□□ 2.37
SLC12A4-208ENST00000572010 PTGER2P43116 358 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC12A4-208ENST00000572010 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
SLC12A4-208ENST00000572010 TESK2Q96S53 571 aa29.86■■■□□ 2.37
SLC12A4-208ENST00000572010 MTFR1LQ9H019 292 aa29.86■■■□□ 2.37
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SLC12A4-208ENST00000572010 NHSQ6T4R5 1651 aa29.83■■■□□ 2.37
SLC12A4-208ENST00000572010 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC12A4-208ENST00000572010 HOXC9P31274 260 aa29.79■■■□□ 2.36
SLC12A4-208ENST00000572010 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
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SLC12A4-208ENST00000572010 FBLN1P23142 703 aa29.76■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 TMF1P82094 1093 aa29.76■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.75■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 ARXQ96QS3 562 aa29.74■■■□□ 2.35
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SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF827Q17R98 1081 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 SGIP1Q9BQI5 828 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.73■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 MYOM1P52179 1685 aa29.72■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 BTAF1O14981 1849 aa29.71■■■□□ 2.35
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 FYB1O15117 783 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.69■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 CDCA8Q53HL2 280 aa29.68■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.68■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 AKT1S1Q96B36 256 aa29.68■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa29.67■■■□□ 2.34
SLC12A4-208ENST00000572010 RTL1A6NKG5 1358 aa29.65■■■□□ 2.34
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