RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564123.6

BBS2-208, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 3

Gene BBS2, Length 395 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-208ENST00000564123 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.68□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 CBLBQ13191 982 aa6.68□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa6.68□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.67□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 MEIOBQ8N635 442 aa6.67□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.67□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 UPP2O95045 317 aa6.66□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 VSIG8P0DPA2 414 aa6.66□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 KRT76Q01546 638 aa6.66□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.66□□□□□ -1.34
BBS2-208ENST00000564123 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.64□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.64□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.64□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.64□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.64□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 RFC5P40937 340 aa6.63□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 PTSQ03393 145 aa6.63□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 ERFEQ4G0M1 354 aa6.63□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.63□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 TTLL8A6PVC2 850 aa6.62□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 FLIIQ13045 1269 aa6.62□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.62□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 NBPF14Q5TI25 921 aa6.62□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.62□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 GSK3AP49840 483 aa6.61□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 NR6A1Q15406 480 aa6.61□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.61□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.61□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 MCM6Q14566 821 aa6.6□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.6□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.6□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.6□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 AP1G2O75843 785 aa6.59□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 RELBQ01201 579 aa6.59□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.59□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.59□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 WHAMMQ8TF30 809 aa6.59□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.59□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
BBS2-208ENST00000564123 RAB15P59190 212 aa6.58□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 KCNMA1Q12791 1236 aa6.58□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 Q6ZVU0 165 aa6.58□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.58□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.58□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.58□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 SPINT1O43278 529 aa6.57□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.57□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 PDXDC2PQ6P474 469 aa6.57□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 ZBTB33Q86T24 672 aa6.57□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 SNRKQ9NRH2 765 aa6.57□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.57□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.57□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.56□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 CDC14CA4D256 554 aa6.56□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 SLC35F4A4IF30 521 aa6.56□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 USP17L8P0C7I0 530 aa6.56□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.56□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 ZMYND15Q9H091 742 aa6.56□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 BANK1Q8NDB2 785 aa6.55□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.55□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.55□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 RASSF7Q02833 373 aa6.54□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 ADAM32Q8TC27 787 aa6.54□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 POM121Q96HA1 1249 aa6.54□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 GDF11O95390 407 aa6.53□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.53□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.53□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
BBS2-208ENST00000564123 ITGA6P23229 1130 aa6.52□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 SVOPQ8N4V2 548 aa6.52□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.51□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.51□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 RAD21O60216 631 aa6.51□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 PTK2Q05397 1052 aa6.51□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 SV2AQ7L0J3 742 aa6.51□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 RNF217Q8TC41 542 aa6.51□□□□□ -1.37
BBS2-208ENST00000564123 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.1 ms