RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560587.1

ZNF280D-215, Transcript of zinc finger protein 280D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZNF280D, Length 1,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF280D-215ENST00000560587 USP35Q9P2H5 1018 aa34.59■■■■□ 3.13
ZNF280D-215ENST00000560587 KRT27Q7Z3Y8 459 aa34.58■■■■□ 3.13
ZNF280D-215ENST00000560587 EP400Q96L91 3159 aa34.58■■■■□ 3.13
ZNF280D-215ENST00000560587 CRB1P82279 1406 aa34.57■■■■□ 3.12
ZNF280D-215ENST00000560587 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
ZNF280D-215ENST00000560587 LTN1O94822 1766 aa34.55■■■■□ 3.12
ZNF280D-215ENST00000560587 RGPD5Q99666 1765 aa34.54■■■■□ 3.12
ZNF280D-215ENST00000560587 TCP11L2Q8N4U5 519 aa34.54■■■■□ 3.12
ZNF280D-215ENST00000560587 BARGINQ6ZT62 677 aa34.53■■■■□ 3.12
ZNF280D-215ENST00000560587 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.53■■■■□ 3.12
ZNF280D-215ENST00000560587 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
ZNF280D-215ENST00000560587 CCDC125Q86Z20 511 aa34.5■■■■□ 3.11
ZNF280D-215ENST00000560587 COG3Q96JB2 828 aa34.5■■■■□ 3.11
ZNF280D-215ENST00000560587 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.5■■■■□ 3.11
ZNF280D-215ENST00000560587 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.48■■■■□ 3.11
ZNF280D-215ENST00000560587 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.48■■■■□ 3.11
ZNF280D-215ENST00000560587 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
ZNF280D-215ENST00000560587 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.46■■■■□ 3.11
ZNF280D-215ENST00000560587 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.45■■■■□ 3.11
ZNF280D-215ENST00000560587 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.44■■■■□ 3.1
ZNF280D-215ENST00000560587 NSD3Q9BZ95 1437 aa34.42■■■■□ 3.1
ZNF280D-215ENST00000560587 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.42■■■■□ 3.1
ZNF280D-215ENST00000560587 FYB1O15117 783 aa34.41■■■■□ 3.1
ZNF280D-215ENST00000560587 GGNBP2Q9H3C7 697 aa34.4■■■■□ 3.1
ZNF280D-215ENST00000560587 ERBB3P21860 1342 aa34.39■■■■□ 3.1
ZNF280D-215ENST00000560587 CARD14Q9BXL6 1004 aa34.38■■■■□ 3.09
ZNF280D-215ENST00000560587 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
ZNF280D-215ENST00000560587 PDE3BQ13370 1112 aa34.37■■■■□ 3.09
ZNF280D-215ENST00000560587 FAM182BQ5T319 152 aa34.37■■■■□ 3.09
ZNF280D-215ENST00000560587 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.37■■■■□ 3.09
ZNF280D-215ENST00000560587 LRRC37A3O60309 1634 aa34.36■■■■□ 3.09
ZNF280D-215ENST00000560587 CCDC7Q96M83 1385 aa34.35■■■■□ 3.09
ZNF280D-215ENST00000560587 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.34■■■■□ 3.09
ZNF280D-215ENST00000560587 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.34■■■■□ 3.09
ZNF280D-215ENST00000560587 IP6K1Q92551 441 aa34.32■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.31■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.3■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.3■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 RTL1A6NKG5 1358 aa34.3■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 AMPHP49418 695 aa34.3■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.29■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 DISP2A7MBM2 1401 aa34.28■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 FBLN1P23142 703 aa34.28■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 DDB1Q16531 1140 aa34.28■■■■□ 3.08
ZNF280D-215ENST00000560587 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 HOXC9P31274 260 aa34.26■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.23■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa34.23■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 BAG6P46379 1132 aa34.22■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa34.22■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 PANK3Q9H999 370 aa34.21■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 PEAK1Q9H792 1746 aa34.21■■■■□ 3.07
ZNF280D-215ENST00000560587 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.19■■■■□ 3.06
ZNF280D-215ENST00000560587 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.19■■■■□ 3.06
ZNF280D-215ENST00000560587 TRIM37O94972 964 aa34.19■■■■□ 3.06
ZNF280D-215ENST00000560587 TNS2Q63HR2 1409 aa34.18■■■■□ 3.06
ZNF280D-215ENST00000560587 FLT4P35916 1363 aa34.17■■■■□ 3.06
ZNF280D-215ENST00000560587 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
ZNF280D-215ENST00000560587 IL2RBP14784 551 aa34.16■■■■□ 3.06
ZNF280D-215ENST00000560587 EXOC5O00471 708 aa34.14■■■■□ 3.06
ZNF280D-215ENST00000560587 NSD2O96028 1365 aa34.12■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 INSRP06213 1382 aa34.12■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.12■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 SBF2Q86WG5 1849 aa34.1■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.1■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.09■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 BCL9O00512 1426 aa34.09■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
ZNF280D-215ENST00000560587 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.07■■■■□ 3.04
ZNF280D-215ENST00000560587 APBA3O96018 575 aa34.06■■■■□ 3.04
ZNF280D-215ENST00000560587 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
ZNF280D-215ENST00000560587 PARD3Q8TEW0 1356 aa34.03■■■■□ 3.04
ZNF280D-215ENST00000560587 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
ZNF280D-215ENST00000560587 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.02■■■■□ 3.04
ZNF280D-215ENST00000560587 NBPF4Q96M43 638 aa34.02■■■■□ 3.04
ZNF280D-215ENST00000560587 POLKQ9UBT6 870 aa34.01■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 MEGF6O75095 1541 aa33.99■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 WASHC2AQ641Q2 1341 aa33.99■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.99■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 USHBP1Q8N6Y0 703 aa33.97■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 RREB1Q92766 1687 aa33.97■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa33.97■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 MORC1Q86VD1 984 aa33.96■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 NHSQ6T4R5 1651 aa33.96■■■■□ 3.03
ZNF280D-215ENST00000560587 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa33.94■■■■□ 3.02
ZNF280D-215ENST00000560587 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.93■■■■□ 3.02
ZNF280D-215ENST00000560587 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
ZNF280D-215ENST00000560587 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
ZNF280D-215ENST00000560587 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.91■■■■□ 3.02
ZNF280D-215ENST00000560587 PTF1AQ7RTS3 328 aa33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms