RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560163.1

RABGGTA-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-214ENST00000560163 USP6P35125 1406 aa28.78■■■□□ 2.2
RABGGTA-214ENST00000560163 NLRP6P59044 892 aa28.78■■■□□ 2.2
RABGGTA-214ENST00000560163 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.78■■■□□ 2.2
RABGGTA-214ENST00000560163 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
RABGGTA-214ENST00000560163 CABP1Q9NZU7 370 aa28.77■■■□□ 2.2
RABGGTA-214ENST00000560163 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
RABGGTA-214ENST00000560163 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.76■■■□□ 2.19
RABGGTA-214ENST00000560163 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.75■■■□□ 2.19
RABGGTA-214ENST00000560163 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.75■■■□□ 2.19
RABGGTA-214ENST00000560163 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.74■■■□□ 2.19
RABGGTA-214ENST00000560163 PTGER2P43116 358 aa28.74■■■□□ 2.19
RABGGTA-214ENST00000560163 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
RABGGTA-214ENST00000560163 PIK3C2AO00443 1686 aa28.72■■■□□ 2.19
RABGGTA-214ENST00000560163 ZBTB7AO95365 584 aa28.7■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.7■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 MYOM1P52179 1685 aa28.69■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.69■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 AKAP12Q02952 1782 aa28.68■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 TXNRD1Q16881 649 aa28.67■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.67■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 RGPD5Q99666 1765 aa28.66■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC15A2Q16348 729 aa28.65■■■□□ 2.18
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.63■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 SYT17Q9BSW7 474 aa28.63■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 STK32BQ9NY57 414 aa28.62■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 EXOC5O00471 708 aa28.61■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.61■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.61■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 MTFR1LQ9H019 292 aa28.58■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.58■■■□□ 2.17
RABGGTA-214ENST00000560163 EVC2Q86UK5 1308 aa28.57■■■□□ 2.16
RABGGTA-214ENST00000560163 NFAT5O94916 1531 aa28.57■■■□□ 2.16
RABGGTA-214ENST00000560163 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.56■■■□□ 2.16
RABGGTA-214ENST00000560163 CCDC7Q96M83 1385 aa28.55■■■□□ 2.16
RABGGTA-214ENST00000560163 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.54■■■□□ 2.16
RABGGTA-214ENST00000560163 TNS2Q63HR2 1409 aa28.53■■■□□ 2.16
RABGGTA-214ENST00000560163 SOX12O15370 315 aa28.53■■■□□ 2.16
RABGGTA-214ENST00000560163 NHSQ6T4R5 1651 aa28.53■■■□□ 2.16
RABGGTA-214ENST00000560163 ABCC6O95255 1503 aa28.53■■■□□ 2.16
RABGGTA-214ENST00000560163 CHD4Q14839 1912 aa28.51■■■□□ 2.15
RABGGTA-214ENST00000560163 PAPPAQ13219 1627 aa28.51■■■□□ 2.15
RABGGTA-214ENST00000560163 MAP3K5Q99683 1374 aa28.48■■■□□ 2.15
RABGGTA-214ENST00000560163 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.47■■■□□ 2.15
RABGGTA-214ENST00000560163 ARXQ96QS3 562 aa28.47■■■□□ 2.15
RABGGTA-214ENST00000560163 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
RABGGTA-214ENST00000560163 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.46■■■□□ 2.15
RABGGTA-214ENST00000560163 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
RABGGTA-214ENST00000560163 ERBB3P21860 1342 aa28.43■■■□□ 2.14
RABGGTA-214ENST00000560163 USP31Q70CQ4 1352 aa28.43■■■□□ 2.14
RABGGTA-214ENST00000560163 BTAF1O14981 1849 aa28.42■■■□□ 2.14
RABGGTA-214ENST00000560163 ZNF827Q17R98 1081 aa28.42■■■□□ 2.14
RABGGTA-214ENST00000560163 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.42■■■□□ 2.14
RABGGTA-214ENST00000560163 USP54Q70EL1 1684 aa28.42■■■□□ 2.14
RABGGTA-214ENST00000560163 C1QTNF8P60827 252 aa28.41■■■□□ 2.14
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RABGGTA-214ENST00000560163 IL2RBP14784 551 aa28.4■■■□□ 2.14
RABGGTA-214ENST00000560163 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.39■■■□□ 2.14
RABGGTA-214ENST00000560163 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.36■■■□□ 2.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.35■■■□□ 2.13
RABGGTA-214ENST00000560163 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.35■■■□□ 2.13
RABGGTA-214ENST00000560163 LTN1O94822 1766 aa28.35■■■□□ 2.13
RABGGTA-214ENST00000560163 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
RABGGTA-214ENST00000560163 NME9Q86XW9 330 aa28.34■■■□□ 2.13
RABGGTA-214ENST00000560163 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.34■■■□□ 2.13
RABGGTA-214ENST00000560163 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.34■■■□□ 2.13
RABGGTA-214ENST00000560163 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.33■■■□□ 2.13
RABGGTA-214ENST00000560163 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.33■■■□□ 2.13
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RABGGTA-214ENST00000560163 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.3■■■□□ 2.12
RABGGTA-214ENST00000560163 CEP350Q5VT06 3117 aa28.3■■■□□ 2.12
RABGGTA-214ENST00000560163 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.3■■■□□ 2.12
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RABGGTA-214ENST00000560163 POLD1P28340 1107 aa28.23■■■□□ 2.11
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RABGGTA-214ENST00000560163 KCNQ4P56696 695 aa28.21■■■□□ 2.11
RABGGTA-214ENST00000560163 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.21■■■□□ 2.11
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RABGGTA-214ENST00000560163 LY75O60449 1722 aa28.19■■■□□ 2.1
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RABGGTA-214ENST00000560163 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
RABGGTA-214ENST00000560163 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
RABGGTA-214ENST00000560163 KLHL34Q8N239 644 aa28.19■■■□□ 2.1
RABGGTA-214ENST00000560163 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.18■■■□□ 2.1
RABGGTA-214ENST00000560163 TMC1Q8TDI8 760 aa28.18■■■□□ 2.1
RABGGTA-214ENST00000560163 NSD2O96028 1365 aa28.18■■■□□ 2.1
RABGGTA-214ENST00000560163 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.18■■■□□ 2.1
RABGGTA-214ENST00000560163 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RABGGTA-214ENST00000560163 A0A1W2PP64 1363 aa28.16■■■□□ 2.1
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