RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.14■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.14■■■■□ 3.06
PBX1-217ENST00000559578 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.13■■■■□ 3.05
PBX1-217ENST00000559578 LRRC37A3O60309 1634 aa34.12■■■■□ 3.05
PBX1-217ENST00000559578 PEAK1Q9H792 1746 aa34.11■■■■□ 3.05
PBX1-217ENST00000559578 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
PBX1-217ENST00000559578 SOX12O15370 315 aa34.1■■■■□ 3.05
PBX1-217ENST00000559578 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
PBX1-217ENST00000559578 WNK3Q9BYP7 1800 aa34.07■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.07■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 RGPD5Q99666 1765 aa34.07■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.06■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 SBF2Q86WG5 1849 aa34.06■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.04■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.03■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.02■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 PLSCR1O15162 318 aa34.02■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 NFAT5O94916 1531 aa34.02■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.02■■■■□ 3.04
PBX1-217ENST00000559578 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
PBX1-217ENST00000559578 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
PBX1-217ENST00000559578 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.99■■■■□ 3.03
PBX1-217ENST00000559578 ABCC6O95255 1503 aa33.99■■■■□ 3.03
PBX1-217ENST00000559578 BCL9O00512 1426 aa33.97■■■■□ 3.03
PBX1-217ENST00000559578 CCDC7Q96M83 1385 aa33.97■■■■□ 3.03
PBX1-217ENST00000559578 TMC1Q8TDI8 760 aa33.96■■■■□ 3.03
PBX1-217ENST00000559578 USP31Q70CQ4 1352 aa33.96■■■■□ 3.03
PBX1-217ENST00000559578 EXOC5O00471 708 aa33.95■■■■□ 3.03
PBX1-217ENST00000559578 SPON1Q9HCB6 807 aa33.94■■■■□ 3.02
PBX1-217ENST00000559578 PTF1AQ7RTS3 328 aa33.93■■■■□ 3.02
PBX1-217ENST00000559578 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
PBX1-217ENST00000559578 TONSLQ96HA7 1378 aa33.92■■■■□ 3.02
PBX1-217ENST00000559578 CD163L1Q9NR16 1453 aa33.92■■■■□ 3.02
PBX1-217ENST00000559578 USP54Q70EL1 1684 aa33.92■■■■□ 3.02
PBX1-217ENST00000559578 NME9Q86XW9 330 aa33.91■■■■□ 3.02
PBX1-217ENST00000559578 KCNQ2O43526 872 aa33.9■■■■□ 3.02
PBX1-217ENST00000559578 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
PBX1-217ENST00000559578 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.88■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 TERF2IPQ9NYB0 399 aa33.87■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 LTN1O94822 1766 aa33.87■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 TNS2Q63HR2 1409 aa33.86■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 ERBB3P21860 1342 aa33.85■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.85■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 PROM2Q8N271 834 aa33.84■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
PBX1-217ENST00000559578 A0A1W2PP64 1363 aa33.8■■■■□ 3
PBX1-217ENST00000559578 IL2RBP14784 551 aa33.79■■■■□ 3
PBX1-217ENST00000559578 TXNRD1Q16881 649 aa33.79■■■■□ 3
PBX1-217ENST00000559578 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.79■■■■□ 3
PBX1-217ENST00000559578 CASZ1Q86V15 1759 aa33.77■■■■□ 3
PBX1-217ENST00000559578 NINLQ9Y2I6 1382 aa33.77■■■■□ 3
PBX1-217ENST00000559578 STK32BQ9NY57 414 aa33.77■■■■□ 3
PBX1-217ENST00000559578 NHSQ6T4R5 1651 aa33.74■■■□□ 2.99
PBX1-217ENST00000559578 DCAF8L1A6NGE4 600 aa33.74■■■□□ 2.99
PBX1-217ENST00000559578 ACSBG1Q96GR2 724 aa33.73■■■□□ 2.99
PBX1-217ENST00000559578 SLC24A1O60721 1099 aa33.72■■■□□ 2.99
PBX1-217ENST00000559578 SLC15A2Q16348 729 aa33.71■■■□□ 2.99
PBX1-217ENST00000559578 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
PBX1-217ENST00000559578 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa33.7■■■□□ 2.99
PBX1-217ENST00000559578 KAT6BQ8WYB5 2073 aa33.69■■■□□ 2.98
PBX1-217ENST00000559578 ZBTB7AO95365 584 aa33.69■■■□□ 2.98
PBX1-217ENST00000559578 IP6K1Q92551 441 aa33.69■■■□□ 2.98
PBX1-217ENST00000559578 TESK2Q96S53 571 aa33.69■■■□□ 2.98
PBX1-217ENST00000559578 YY1P25490 414 aa33.66■■■□□ 2.98
PBX1-217ENST00000559578 COG3Q96JB2 828 aa33.66■■■□□ 2.98
PBX1-217ENST00000559578 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
PBX1-217ENST00000559578 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
PBX1-217ENST00000559578 BTAF1O14981 1849 aa33.63■■■□□ 2.97
PBX1-217ENST00000559578 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
PBX1-217ENST00000559578 PTGER2P43116 358 aa33.61■■■□□ 2.97
PBX1-217ENST00000559578 MYOM1P52179 1685 aa33.59■■■□□ 2.97
PBX1-217ENST00000559578 MTFR1LQ9H019 292 aa33.59■■■□□ 2.97
PBX1-217ENST00000559578 MAP3K19Q56UN5 1328 aa33.58■■■□□ 2.97
PBX1-217ENST00000559578 AMPHP49418 695 aa33.58■■■□□ 2.97
PBX1-217ENST00000559578 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
PBX1-217ENST00000559578 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.57■■■□□ 2.96
PBX1-217ENST00000559578 HOXC9P31274 260 aa33.56■■■□□ 2.96
PBX1-217ENST00000559578 PAPPAQ13219 1627 aa33.55■■■□□ 2.96
PBX1-217ENST00000559578 TMF1P82094 1093 aa33.53■■■□□ 2.96
PBX1-217ENST00000559578 FBLN1P23142 703 aa33.52■■■□□ 2.96
PBX1-217ENST00000559578 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.49■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 RTL1A6NKG5 1358 aa33.48■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 USP47Q96K76 1375 aa33.48■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.48■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 RGPD2P0DJD1 1756 aa33.47■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 ZNF827Q17R98 1081 aa33.47■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 SGIP1Q9BQI5 828 aa33.47■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 SYT17Q9BSW7 474 aa33.47■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 FYB1O15117 783 aa33.46■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 GGNBP2Q9H3C7 697 aa33.45■■■□□ 2.95
PBX1-217ENST00000559578 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
PBX1-217ENST00000559578 CDCA8Q53HL2 280 aa33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms