RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 USP31Q70CQ4 1352 aa28.45■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.44■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 LRP5O75197 1615 aa28.43■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.42■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 RGPD5Q99666 1765 aa28.42■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 SOX12O15370 315 aa28.41■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 USP54Q70EL1 1684 aa28.41■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 PEAK1Q9H792 1746 aa28.4■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 TMC1Q8TDI8 760 aa28.4■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 LRRC37A3O60309 1634 aa28.4■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 DDB1Q16531 1140 aa28.39■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 TESK2Q96S53 571 aa28.39■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.39■■■□□ 2.14
MFGE8-208ENST00000558773 ABCC6O95255 1503 aa28.38■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 NME9Q86XW9 330 aa28.38■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.37■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa28.36■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.36■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.36■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 RREB1Q92766 1687 aa28.36■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.35■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.35■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.33■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 A0A1W2PP64 1363 aa28.33■■■□□ 2.13
MFGE8-208ENST00000558773 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 SBF2Q86WG5 1849 aa28.32■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 SLC24A1O60721 1099 aa28.31■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 BCL9O00512 1426 aa28.31■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.3■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC7Q96M83 1385 aa28.3■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.28■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 ERBB3P21860 1342 aa28.27■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 PLSCR1O15162 318 aa28.27■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
MFGE8-208ENST00000558773 EXOC5O00471 708 aa28.26■■■□□ 2.11
MFGE8-208ENST00000558773 NBPF14Q5TI25 921 aa28.26■■■□□ 2.11
MFGE8-208ENST00000558773 LTN1O94822 1766 aa28.26■■■□□ 2.11
MFGE8-208ENST00000558773 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.25■■■□□ 2.11
MFGE8-208ENST00000558773 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
MFGE8-208ENST00000558773 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.24■■■□□ 2.11
MFGE8-208ENST00000558773 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.2■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.2■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 TNS2Q63HR2 1409 aa28.19■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 IP6K1Q92551 441 aa28.18■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 USP47Q96K76 1375 aa28.17■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 PROM2Q8N271 834 aa28.17■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.16■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 IL2RBP14784 551 aa28.16■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 TMF1P82094 1093 aa28.15■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 COG3Q96JB2 828 aa28.14■■■□□ 2.1
MFGE8-208ENST00000558773 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.13■■■□□ 2.09
MFGE8-208ENST00000558773 KCNQ2O43526 872 aa28.11■■■□□ 2.09
MFGE8-208ENST00000558773 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.11■■■□□ 2.09
MFGE8-208ENST00000558773 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
MFGE8-208ENST00000558773 FBLN1P23142 703 aa28.09■■■□□ 2.09
MFGE8-208ENST00000558773 NHSQ6T4R5 1651 aa28.08■■■□□ 2.09
MFGE8-208ENST00000558773 FYB1O15117 783 aa28.08■■■□□ 2.09
MFGE8-208ENST00000558773 HOXC9P31274 260 aa28.08■■■□□ 2.09
MFGE8-208ENST00000558773 TXNRD1Q16881 649 aa28.08■■■□□ 2.09
MFGE8-208ENST00000558773 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
MFGE8-208ENST00000558773 CDCA8Q53HL2 280 aa28.06■■■□□ 2.08
MFGE8-208ENST00000558773 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
MFGE8-208ENST00000558773 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.06■■■□□ 2.08
MFGE8-208ENST00000558773 SPON1Q9HCB6 807 aa28.05■■■□□ 2.08
MFGE8-208ENST00000558773 AMPHP49418 695 aa28.04■■■□□ 2.08
MFGE8-208ENST00000558773 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.04■■■□□ 2.08
MFGE8-208ENST00000558773 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.03■■■□□ 2.08
MFGE8-208ENST00000558773 CASZ1Q86V15 1759 aa28.01■■■□□ 2.08
MFGE8-208ENST00000558773 RTL1A6NKG5 1358 aa28■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 SLC15A2Q16348 729 aa27.98■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.98■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.97■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.97■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 STK32BQ9NY57 414 aa27.97■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 BTAF1O14981 1849 aa27.97■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 MYOM1P52179 1685 aa27.95■■■□□ 2.07
MFGE8-208ENST00000558773 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.94■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 NBPF4Q96M43 638 aa27.94■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.94■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 PAPPAQ13219 1627 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 MEGF6O75095 1541 aa27.91■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 INSRP06213 1382 aa27.9■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.89■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.89■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 ZBTB7AO95365 584 aa27.89■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.89■■■□□ 2.06
MFGE8-208ENST00000558773 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms