RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557779.1

TMEM229B-208, Transcript of transmembrane protein 229B, humanhuman

TSL 2

Gene TMEM229B, Length 701 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229B-208ENST00000557779 TERF2IPQ9NYB0 399 aa34.08■■■■□ 3.05
TMEM229B-208ENST00000557779 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
TMEM229B-208ENST00000557779 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
TMEM229B-208ENST00000557779 SLC24A1O60721 1099 aa34.07■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 PDE3BQ13370 1112 aa34.07■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.07■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.06■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 DISP2A7MBM2 1401 aa34.06■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 ABCC6O95255 1503 aa34.06■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 USP47Q96K76 1375 aa34.06■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.05■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.05■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.04■■■■□ 3.04
TMEM229B-208ENST00000557779 TRIM37O94972 964 aa34.01■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.01■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.01■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 RGPD5Q99666 1765 aa33.99■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 LRRC37A3O60309 1634 aa33.99■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa33.98■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 OVOS2Q6IE36 1432 aa33.98■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 WNK3Q9BYP7 1800 aa33.97■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa33.96■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 CARD10Q9BWT7 1032 aa33.95■■■■□ 3.03
TMEM229B-208ENST00000557779 TMF1P82094 1093 aa33.94■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 DDB1Q16531 1140 aa33.92■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.92■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa33.92■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 PEAK1Q9H792 1746 aa33.92■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 LTN1O94822 1766 aa33.91■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 APBA3O96018 575 aa33.9■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.9■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 CCDC7Q96M83 1385 aa33.89■■■■□ 3.02
TMEM229B-208ENST00000557779 PARD3Q8TEW0 1356 aa33.88■■■■□ 3.01
TMEM229B-208ENST00000557779 ERBB3P21860 1342 aa33.88■■■■□ 3.01
TMEM229B-208ENST00000557779 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
TMEM229B-208ENST00000557779 CDCA8Q53HL2 280 aa33.83■■■■□ 3.01
TMEM229B-208ENST00000557779 COG3Q96JB2 828 aa33.82■■■■□ 3
TMEM229B-208ENST00000557779 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
TMEM229B-208ENST00000557779 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.81■■■■□ 3
TMEM229B-208ENST00000557779 RREB1Q92766 1687 aa33.8■■■■□ 3
TMEM229B-208ENST00000557779 BCL9O00512 1426 aa33.79■■■■□ 3
TMEM229B-208ENST00000557779 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.79■■■■□ 3
TMEM229B-208ENST00000557779 TNS2Q63HR2 1409 aa33.79■■■■□ 3
TMEM229B-208ENST00000557779 IP6K1Q92551 441 aa33.77■■■■□ 3
TMEM229B-208ENST00000557779 EXOC5O00471 708 aa33.76■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 SBF2Q86WG5 1849 aa33.76■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 LRP5O75197 1615 aa33.75■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.74■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 MAP3K19Q56UN5 1328 aa33.74■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 MYOM1P52179 1685 aa33.74■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 FYB1O15117 783 aa33.73■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 IL2RBP14784 551 aa33.7■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 FBLN1P23142 703 aa33.7■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 GGNBP2Q9H3C7 697 aa33.7■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
TMEM229B-208ENST00000557779 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa33.7■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 HOXC9P31274 260 aa33.69■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 PTF1AQ7RTS3 328 aa33.69■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 PLSCR1O15162 318 aa33.67■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 RTL1A6NKG5 1358 aa33.67■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 AMPHP49418 695 aa33.66■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 KIF20BQ96Q89 1820 aa33.65■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 CARD14Q9BXL6 1004 aa33.64■■■□□ 2.98
TMEM229B-208ENST00000557779 NSD3Q9BZ95 1437 aa33.63■■■□□ 2.97
TMEM229B-208ENST00000557779 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP33.62■■■□□ 2.97
TMEM229B-208ENST00000557779 NBPF14Q5TI25 921 aa33.62■■■□□ 2.97
TMEM229B-208ENST00000557779 NHSQ6T4R5 1651 aa33.58■■■□□ 2.97
TMEM229B-208ENST00000557779 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.57■■■□□ 2.96
TMEM229B-208ENST00000557779 KCNQ2O43526 872 aa33.55■■■□□ 2.96
TMEM229B-208ENST00000557779 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
TMEM229B-208ENST00000557779 PROM2Q8N271 834 aa33.53■■■□□ 2.96
TMEM229B-208ENST00000557779 ACSBG1Q96GR2 724 aa33.53■■■□□ 2.96
TMEM229B-208ENST00000557779 KIF24Q5T7B8 1368 aa33.52■■■□□ 2.96
TMEM229B-208ENST00000557779 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
TMEM229B-208ENST00000557779 RGPD2P0DJD1 1756 aa33.51■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 INSRP06213 1382 aa33.5■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 FLT4P35916 1363 aa33.5■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 POLR3GLQ9BT43 218 aa33.5■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 MEGF6O75095 1541 aa33.49■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 NBPF6Q5VWK0 638 aa33.48■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 NBPF4Q96M43 638 aa33.48■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 CGNL1Q0VF96 1302 aa33.48■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 TXNRD1Q16881 649 aa33.47■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa33.47■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
TMEM229B-208ENST00000557779 USHBP1Q8N6Y0 703 aa33.43■■■□□ 2.94
TMEM229B-208ENST00000557779 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa33.43■■■□□ 2.94
TMEM229B-208ENST00000557779 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.42■■■□□ 2.94
TMEM229B-208ENST00000557779 BTAF1O14981 1849 aa33.42■■■□□ 2.94
TMEM229B-208ENST00000557779 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms